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Ramos, Juan-Luis 1956-

Overview
Works: 48 works in 169 publications in 2 languages and 2,129 library holdings
Genres: Laboratory manuals 
Roles: Editor, Author
Classifications: QR82.P78, 579.332
Publication Timeline
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Most widely held works by Juan-Luis Ramos
Pseudomonas by Juan-Luis Ramos( )

68 editions published between 2004 and 2016 in English and held by 1,008 WorldCat member libraries worldwide

TwentyyearshavegonebysinceJackSokatch?rstpublishedhisoutsta- ingTheBiologyofPseudomonasbackin1986.Thiswasfollowedbytwobooks published by the ASM that contained the presentations of the Pseudomonas meetings held in Chicago in 1989 and Trieste in 1991. The earlier volume of these two was edited by Simon Silver, Al Chakrabarty, Barbara Iglewski, and Sam Kaplan, and the later one by Enrica Galli, Simon Silver, and Bernard Witholt. The time was ripe for a series of books on Pseudomonas because of its importance in human and plant pathogenesis, bio?lms, soil and rhizosphere colonization, etc. Efforts were devoted to produce the ?rst three volumes of the series on the biology of Pseudomonas after a meeting with Kluwer staff members in August 2002 during the XI IUMS conference in Paris (France). In less than a year a group of outstanding scientists in the ?eld, after devoting much of their valuable time, managed to complete their chapters for the three volumes of the series. To ensure the high standard of each chapter, renowned scientists participated in the reviewing process. The three books collected part of the "explosion" of new vital information on the genus Pseudomonas
Pseudomonas( )

7 editions published between 2004 and 2006 in English and held by 429 WorldCat member libraries worldwide

Pseudomonas : Volume 6: Molecular Microbiology, Infection and Biodiversity by Juan-Luis Ramos( )

11 editions published between 2010 and 2015 in English and held by 336 WorldCat member libraries worldwide

The five previous volumes of "Pseudomonas Series" covered the biology of pseudomonads in a wide context, including the niches they inhabit, the taxonomic relations among members of this group, the molecular biology of gene expression in different niches and under different environmental conditions, the analysis of virulence traits in plants, animals and human pathogens as well as the determinants that make some strains useful for biotechnological applications and promotion of plant growth. "Pseudomonas, Volume 6" is intended to collect new information on molecular microbiol
Pseudomonas : methods and protocols by Alain Filloux( )

11 editions published in 2014 in English and held by 153 WorldCat member libraries worldwide

"In Pseudomonas aeruginosa, expert researchers in the field detail many of the methods which are now commonly used to study this fascinating microorganism. Chapters include microbiological methods to high-throughput molecular techniques that have been developed over the last decade. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and key tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Authoritative and practical, Pseudomonas aeruginosa aids in the continuing study of new and cutting edge findings."--Back cover
Pseudomonas by Juan-Luis Ramos( )

10 editions published in 2004 in English and held by 66 WorldCat member libraries worldwide

Pseudomonas comprises three volumes covering the biology of pseudomonads in a wide context, including the niches they inhabit, the taxonomic relations among members of this group, the molecular biology of gene expression in different niches and under different environmental conditions, the analysis of virulence traits in plants, animals and human pathogens as well as the determinants that make some strains useful for biotechnological applications and promotion of plant growth. There has been growing interest in pseudomonads and a particular urge to understand the biology underlying the complex metabolism of these ubiquitous microbes. These bacteria are capable of colonizing a wide range of niches, including the soil, the plant rhizosphere and phylosphere, and animal tissues; more recently they have attracted attention because of their capacity to form biofilms, a characteristic with potentially important medical and environmental implications. The three volumes cover the following topics: - Taxonomy, - Genomics, - Life styles, - Cell Architecture, - Virulence, - Regulation, - Macromolecules, - Alternative Respiratory Substrates, - Catabolism and Biotransformations. Pseudomonas will be of use to all researchers working on these bacteria, particularly those studying microbiology, plant crops, pathogenesis, and chemical engineering. Advanced students in biology, medicine and agronomy will also find these three volumes a valuable reference during their studies
Pseudomonas by Juan-Luis Ramos( )

8 editions published in 2004 in English and held by 61 WorldCat member libraries worldwide

Volume I:- Taxonomy. 1. Taxonomy of Pseudomonads; N. Palleroni, E. Moore. Genomics. 2. The genome of Pseudomonas aeruginosa; B.R. Kulasekara, S. Lory. 3. Genomic Features of Pseudomonas putida Strain KT2440; V.A.P. Martins dos Santos, K.N. Timmis, B. Tümmler, C. Weinel. 4. The Genome of Pseudomonas syringae Tomato DC3000 and Functional Genomic Studies to better Understand Plant Pathogenesis; Y. Jamir, X. Tang, J.R. Alfano. 5. Comparative Genomics of Four Pseudomonas Species; L. Juhl Jensen, M. Skovgaard, T. Sicheritz-Pontén, N. Tue Hansen, H. Johansson, M. Kjær Jørgensen, K. Kiil, P.F. Hallin
Pseudomonas( Book )

7 editions published in 2004 in English and held by 14 WorldCat member libraries worldwide

Con pájaros que ignoro : poesía reunida (1979-1989) by Juan-Luis Ramos( Book )

4 editions published in 2017 in Spanish and held by 12 WorldCat member libraries worldwide

Virulence and Gene Regulation by Juan-Luis Ramos( Book )

2 editions published between 2004 and 2013 in English and held by 7 WorldCat member libraries worldwide

Pseudomonas comprises three volumes covering the biology of pseudomonads in a wide context, including the niches they inhabit, the taxonomic relations among members of this group, the molecular biology of gene expression in different niches and under different environmental conditions, the analysis of virulence traits in plants, animals and human pathogens as well as the determinants that make some strains useful for biotechnological applications and promotion of plant growth. There has been growing interest in pseudomonads and a particular urge to understand the biology underlying the complex metabolism of these ubiquitous microbes. These bacteria are capable of colonizing a wide range of niches, including the soil, the plant rhizosphere and phylosphere, and animal tissues; more recently they have attracted attention because of their capacity to form biofilms, a characteristic with potentially important medical and environmental implications. The three volumes cover the following topics: - Taxonomy, - Genomics, - Life styles, - Cell Architecture, - Virulence, - Regulation, - Macromolecules, - Alternative Respiratory Substrates, - Catabolism and Biotransformations. Pseudomonas will be of use to all researchers working on these bacteria, particularly those studying microbiology, plant crops, pathogenesis, and chemical engineering. Advanced students in biology, medicine and agronomy will also find these three volumes a valuable reference during their studies
Pseudomonas : Volume 7: New Aspects of Pseudomonas Biology by Juan-Luis Ramos( )

1 edition published in 2015 in English and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

Pseudomonas volume 7 collects some of the most relevant and emerging issues in the biology of these microorganisms, and a number of other important issues that were not collected in the previous volumes. The first six volumes of the Pseudomonas series covered the biology of pseudomonads in a wide range of contexts, including the niches they inhabit, the taxonomic relations among its members of this group, the molecular biology of gene expression in different niches and under different environmental conditions, the analysis of virulence in plants, animal and human pathogens, as well as the determinants that make some of these strains of interesting for biotechnological applications. This seventh volume covers the following topics: The history of the biology of Pseudomonas The use of Pseudomonas as biological agents New trends in the molecular biology of these microorganisms Pseudomonas and the immune system of insects and animals This book will be of use to researchers working on these bacteria, particularly those studying medical aspects of Pseudomonas, and their use as a means to control pathogens or to stimulate plant growth. This volume is also interesting for those studying the physiology, genetics, molecular biology of Pseudomonas and those using novel-omics approaches to understand bacteria of the genus Pseudomonas
Diagnóstico ambiental de la ría de Huelva( Book )

1 edition published in 2005 in Spanish and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

Respiration of 2,4,6-Trinitrotoluene by Pseudomonas sp. Strain JLR11 by Abraham Esteve-Nuñez( )

2 editions published between 2000 and 2007 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Molecular biology of emerging issues( Book )

2 editions published between 2006 and 2007 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Pseudomonas( )

in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Caracterización química de Alpechin como base para desarrollar una estrategia biológica para su eliminación by Matilde Gil García( Book )

1 edition published in 1999 in Spanish and held by 1 WorldCat member library worldwide

La industria almacerera produce unas aguas residuales denominadas alpechín, que por sus características físico-químicas constituye un importante problema de contaminación medioambiental y cuyo tratamiento es prioritario. A lo largo del tiempo se han desarrollado una serie de investigaciones encaminadas al tratamiento de este contaminante. Se considera que la alternativa más adecuada es el tratamiento biológico desde el punto de vista económico y medioambiental. Esta tesis doctoral se concibió como un primer paso hacia el tratamiento biológico de alpechín. Los objetivos de la misma fueron: 1- Caracterización química del alpechín y otros derivados de la mol-turación de aceituna en la obtención de aceite de oliva. 2- Aislamiento de microorganismos adecuados que sena capaces de utilizar los compuestos presentes en el contaminante como fuente de carbono y energía. 3- Caracterización inicial de algunas de las rutas catabólicas seguidas en el proceso de biodegradación de ciertos compuestos presentes en el alpechín. 4- Estudio de la organización de los genes implicados en la ruta de degradación del ácido p-hidroxifenilacético por microorganismos aislados en este estudio. Respecto al primer objetivo se analizaron químicamente los residuos obtenidos en los diferentes sistemas de producción de aceite de oliva. Con cada uno de ellos se realizaconuna serie de extracciones fraccionadas y los diferentes extractos obtenidos se estudiaron independientemente. Estos se sometieron a diferentes y progresivas derivatizaciones y cromatografías sobre sílica gel en columna así como en capa fina preparativa, lo cual permitió el aislamiento de una serie de productos puros cuyas estructuras fueron deducidas mediante una serie de pruebas espectroscópicas en la mayoría de los casos y mediante la realización de reacciones químicas en otros. Algunas fracciones se analizaronpor CG-EIMS lo cual permitió la identificación de un amplio número de compuestos. Respecto al segundo objetivo se llevaron a cabo una serie de enriquecimientos en los que se utilizó como fuente de carbono compuestos componenetes de alpechín y se utiliizaron diferentes sustratos de origen. De estos enriquecimientos se aislaron 456 muestras. Respecto al tercer objetivo nos centramos en el estudio de la ruta catabólica para la degradación del ácido-o-anísico con las 4 muestras aisladas en los enriquecimientos, 3 cepas puras y un consorcio bacteriano. Tras una serie de ensayos se elucidó la ruta catabólica para la degradación de este ácdio. Respecto al cuarto objetivo se seleccionaron 20 cepas de diferentes géneros de las 60 aisladas en los enriquecimientos utilizando el ácido p-hidroxifenilacético como fuente de carbono y se estudió la organización de los genes implicados en su ruta catabólica. Para ello se disponía de dos sondas que contenían los genes que codificaban el enzima 4-hidroxifenilacético-3-hidroxilasa (hpaB) y el enzima 3,4-dihidroxifenilacético-3,4-dioxigensa /hapD) de E. Colio. Se aisló al ADN genómico de las cepas en estudio y las sondas se marcaron con digoxigenina y se llevaron a cabo una serie de hibridaciones
Mecanismos de Transporte y Biodegradación de p-hidroxibenzoato y Síntesis de Metionina en Pseudomonas putida DOT-T1E by Miguel Alaminos Mingorance( Book )

1 edition published in 2000 in Spanish and held by 1 WorldCat member library worldwide

La cepa Pseudomonas putida DOT-T1E presenta un enorme potencial catabólico debido a su capacidad para utilizar diversos tóxicos orgánicos como fuentes de carbono, lo cual la convierte enuna herramienta muy útil para la biodegradación de los mismos. Uno de los compuestos que pede metablizar esta cepa es el p-hidroxibenzoato, liberado al medio ambiente como producto de desecho por parte de numerosas industrias químicas y farmacéuticas, siendo muy tóxico para la mayor parte de los organismos vivos. En este trabajo, se han caracterizado tres genes relacionados con el metabolismo degradativo de p-hidroxibenzoato, que se denominaron pcaR, pcaK y pacaF. El gen pacaK se demostró que codificabauna proteína pcaK encargada del trasnporte de p-hidroxibenzoato hacia el citoplasma celulara para su degradación posterior por parte de los productos de los genes pca. El gen pcaR codificaba una proteína reguladora del ciclo de degrdación de este compuesto aromático, que se denominó ciclo del b-cetoadipato puesto que este compuesto se sintetizaba como producto intermediario de dicho ciclo. Finalmente, el producto del gen pcaF catalizaba la conversión del b-cetoadipil-CoA en intermediarios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos, no liberándose ningún compuesto xenobiótico recalcitrante durante este proceso. Mediante la construcción de mutantes deficientes en el gen pcaK y posterior caracterización fenotípica de los mismos, pudeo demostrarse el papel fundamental del trasnportador PcaK en la incorporación de p-hidroxibenzoato a la célula, en especial a pH alcalinos, no apreciándose diferencias respecto a la estirpe silvestres cuando las células se cultivaron en medios mínimos enriquecidos consuccinato, glucosa o benzoato. Los experimentos de RT-PCR demostraron que los tres genes se transcribían independientemente unos de otros, formando tres unidades transcripcionales distintas y tres ARNm distintos. De igual modo, se comprobó el papel de PcaK como agente quimotáctico necesario para la migración polar de las células hacia una fuente de p-hidroxibenzoato en un grdaiente de este compuesto, así como la no influencia de esta proteína en la tolerancia a elevadas concentraciones de este ácido aromático. La síntesis de metionina es un proceso complejo que se ha descrito en enterobacterias y ciertos organismo gram-positivos. Sin embargo, no se conoce la ruta de síntesis de este aminoácido en la especie Pseudomans putida, patónego oportunista de animales y plantas. El conocimiento del mecanismo biosintético de la mitionina en Pseudomonas podría ser la base de una nueva generaciónde antibióticos que actuasen inhibiendo la síntesis de este compuesto, pues se ha demostrado una myor patogenicidad de las cepas autxótrofas para la metionina en especial en pacientes afectos de fibrosis quística. Además, un enzima implicado en la transformación de la metionina, denominado metioninasa, se ha demostrado útil en la lucha contra el cáncer en pacientes afectos de metástasisi sistématicas. En este trabajos, mediante técnicas de PCR e hibridación en southern, se han logrado amplificar los genes implicados enla ruta de síntesis de metionina, los cuales se utilizaron ulteriormente para la construcción de estirpes mutantes en estos genes. De este modo, se pudo determinar la implicaciónde los genes metX y netW en la transformación de la homoserina en O-acetil-homoserina, así como la transformación de este último compuesto en homocisteína por acción del producto delgen metZ, mediante una sulfhidrilacióndirecta. Finalmente, se comprobó la transformación de la homocisteína en metionina mediante el producto del gen metE, el cual no se había identificado previamente en especies del género Pseudomonas, o mediante el producto del gen metH, siendo ambas rutas paralelas. A continuación, se identificó un gen reguladro positivo de la ruta, que se denomió netR por su similitud realtiva conlos genes metR descritos previamente en Escherichia coli, Salmonella tiphymurium y Haemophilus influenzae. Es la primera vez que se demuestra la presencia de este regulador enPseudomonas. La construcción de mutantes deficientes en el gen metR demostró su papel como inductor de los demás genes implicados enla biosíntesis de la metionina en condiciones de deprivaciónde metionina, así como la posible existencia de otros genes reguladores o de otros agentes inductores de dicha ruta. Finalmente, se analizaron las distintas proteínas resultantes de la traducciónd e todos los genes secuenciados, comparándose enlos péptidos depositados en los bancos de proteínas disponibles en Internet para generar distintos alineamientos proteínicos. Después de analizar la parsimonia y la homología, se propusieron distintos árboles evolutivos de dichas proteínas, sugiriendo diversas teorías acerca del origen de los genes y de la relación filogenética de los microorganismos comparados
Pseudomonas( )

1 edition published in 2007 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Eliminación biológica de altas concentraciones de nitrato en efluentes de fabricación de explosivos by Guadalupe Piñar Larrubia( Book )

1 edition published in 1998 in Spanish and held by 1 WorldCat member library worldwide

Dos microorganismos, una bacteria gram-negativa identificada como Klebsiella oxytoca CECT 4460, y otra gram-positiva identificada como Arthrobacter globiformis CECT 4500, tolerantes a concentraciones de al menos 1M de nitrato, fueron aislados de los suelos de la fábrica Páramo de Masa (Burgos) perteneciente a Unión Española de Explosivos (UEE). Estas bacterias, en condiciones de aerobiosis, utilizaron una gran variedad de sustratos como fuente de carbono, y su crecimiento tuvo lugar cuando la concentración de nitrato en el medio de cultivo fue inferior a 150 mM. Ambas cepas fueron caracterizadas y se llevó a cabo la optimización en el laboratorio del proceso de eliminación de nitrato en aguas residuales procedentes de la fabricación de DNEG por estas cepas. Posteriormente, se procedió al escalado del sistema de eliminación de nitrato en una planta piloto de 40 L de capacidad, la cual fue operada tanto en estanco como en continuo en la fábrica perteneciente a UEE. Se estudió la influencia de la fuente de carbono, glicerol y/o sacarosa, sobre el proceso de eliminación de nitrato por K. oxytoca CECT 4460 en condiciones de laboratorio. Esta cepa eliminó el 99% del nitrato suministrado en el medio de cultivo, sin acumulación de nitrito o amonio, utilizando sacarosa, glicerol, o mezclas de ambas fuentes de carbono en quimiostatos. La razón C:N óptima para el sistema de eliminación de nitrato fue de entre 8 y 10 para tasas de dilución de entre 0,2 h-1 y 0,1 h-1 respectivamente. Por último, se llevó a cabo un aumento en la dosis génica de la nitrito reductasa en K. oxytoca CECT 4460. Para ello se transfirió a esta cepa el gen nasB de Klebsiella pneumoniae, el cual codifica la nitrito reductasa asimilatoria. Se construyeron dos plásmidos de amplio espectro de huésped con el gen nasB de K. pneumoniae, denominados pUPE2 y pUPE3
Regulation of carbohydrate degradation pathways in Pseudomonas involves a versatile set of transcriptional regulators( )

1 edition published in 2018 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Bacteria of the genus Pseudomonas are widespread in nature. In the last decades, members of this genus, especially Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas putida, have acquired great interest because of their interactions with higher organisms. Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that colonizes the lung of cystic fibrosis patients, while P.putida is a soil bacterium able to establish a positive interaction with the plant rhizosphere. Members of Pseudomonas genus have a robust metabolism for amino acids and organic acids as well as aromatic compounds; however, these microbes metabolize a very limited number of sugars. Interestingly, they have three‐pronged metabolic system to generate 6‐phosphogluconate from glucose suggesting an adaptation to efficiently consume this sugar. This review focuses on the description of the regulatory network of glucose utilization in Pseudomonas, highlighting the differences between P.putida and P.aeruginosa . Most interestingly, It is highlighted a functional link between glucose assimilation and exotoxin A production in P.aeruginosa . The physiological relevance of this connection remains unclear, and it needs to be established whether a similar relationship is also found in other bacteria. Abstract : Interplay of regulators for sugar catabolism
 
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Pseudomonas Molecular biology of emerging issues
Covers
PseudomonasPseudomonasPseudomonasPseudomonasMolecular biology of emerging issues
Alternative Names
Juan Luis Ramos Martín biólogo, bioquímico e investigador español

Juan Luis Ramos Martín Spaans onderzoeker

Juan Luis Ramos Martín Spanish researcher and biochemist

Martín, Juan-Luis Ramos 1956-

Ramos, Juan L. 1956-

Ramos, Juan Luis 1956-

Ramos Martin, Juan-Luis

Ramos Martín, Juan-Luis 1956-

Languages
English (132)

Spanish (9)