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La métagénomique : développements et futures applications

Author: Marie-Christine Champomier-Vergès; Monique Zagorec
Publisher: Versailles, France : Éditions Quae, 2015. ©2015
Series: Savoir-faire.
Edition/Format:   eBook : Document : FrenchView all editions and formats
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Details

Genre/Form: Electronic books
Additional Physical Format: Print version:
Métagénomique : développements et futures applications.
Versailles, France : Éditions Quae, ©2015
116 pages
Material Type: Document, Internet resource
Document Type: Internet Resource, Computer File
All Authors / Contributors: Marie-Christine Champomier-Vergès; Monique Zagorec
ISBN: 9782759222940 2759222942
OCLC Number: 909901069
Description: 1 online resource (120 pages) : illustrations.
Contents: ""Sommaire""; ""Avant-propos""; ""1. Techniques et matériels pour la production des données brutes de séquenÃage métagénomique""; ""Introduction""; ""Design expérimental et échantillonnage""; ""Préparation des échantillons et extraction des acides nucléiques""; ""Le séquenÃage à haut débit""; ""Avantages et désavantages pour la métagénomique des technologies NGS les plus populaires""; ""Les futures technologies""; ""Les banques de clones dâ€?ADN métagénomique""; ""Conclusion""; ""Références bibliographiques"" ""2. Analyse des données, logiciels, transformation des data en information, utilisation et modélisation des données""""Introduction""; ""Assemblage""; ""Assignation taxonomique""; ""Classification non supervisée""; ""Prédiction de parties codantes""; ""Analyse fonctionnelle""; ""Intégration des outils""; ""Références bibliographiques""; ""3. Découverte de nouvelles fonctions et familles protéiques : nouveaux défis pour les biotechnologies et lâ€?écologie microbienne""; ""Introduction""; ""Stratégies dâ€?échantillonnage"" ""Le criblage fonctionnel : nouveaux défis pour la découverte de fonctions""""La séquence, témoin de lâ€?originalité""; ""Le criblage dâ€?activité : accélérateur de découverte dâ€?outils biotechnologiques""; ""Conclusion""; ""Références bibliographiques""; ""4. Microbiote intestinal et typage""; ""Introduction""; ""Métagénome du microbiote intestinal humain""; ""Dysfonctions du microbiome intestinal et pathologies""; ""Conclusion""; ""Références bibliographiques""; ""5. Communautés microbiennes des aliments""; ""Introduction"" ""Les techniques à haut débit ciblées pour approfondir la connaissance des communautés microbiennes des aliments""""Les produits fermentés, une grande diversité de denrées et de communautés microbiennes""; ""En occident : la chaîne alimentaire, la viande, le pain, le vin, le fromage""; ""Exemples dâ€?études métagénomiques sur des aliments""; ""Conclusions et perspectives""; ""Références bibliographiques""; ""6. Microbiome du sol""; ""Introduction""; ""Exploration et exploitation des ressources génétiques de sols modÃ?les"" ""Biogéographie et gestion des communautés microbiennes des sols""""Conclusion et perspectives""; ""Références bibliographiques""; ""7. Métagénomique environnementale""; ""Des gÃ?nes aux génomes""; ""Communautés microbiennes complexes""; ""Lâ€?exemple des écosystÃ?mes arséniés""; ""Conclusion et perspectives""; ""Références bibliographiques""; ""8. Microbiomes de la phyllosphÃ?re""; ""Introduction""; ""La phyllosphÃ?re, un habitat extrîme pour les micro-organismes""; ""PremiÃ?res études métagénomiques""; ""Une mine de données génomiques à explorer""
Series Title: Savoir-faire.
Responsibility: Marie-Christine Champomier-Vergès, Monique Zagorec, coord.

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