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Griffiths, Andrew

Overview
Works: 17 works in 50 publications in 3 languages and 699 library holdings
Genres: Handbooks and manuals 
Roles: Author, Thesis advisor, htt, Opponent, Other, Editor
Publication Timeline
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Most widely held works by Andrew Griffiths
Pre-hospital anaesthesia handbook by Andrew Griffiths( )

29 editions published between 2010 and 2016 in 3 languages and held by 680 WorldCat member libraries worldwide

This second edition handbook details new and improved procedures, current drugs and updated algorithms used by the crews of the Great North Air Ambulance who have been providing this life saving intervention since 2004. It will be of interest to pre-hospital care doctors and trainees, especially those studying for the GNAAS course. Pre-Hospital Anaesthesia is one of the most demanding interventions that can be made in the field. The exact incidence of failed intubation is difficult to quantify, but it is clear that it is higher than in hospital. Equally it is certain that anyone undertaking it should have clear instruction in the technique and a thorough understanding of all it entails
Isotretinoin in acne : proceedings of a workshop, London, 2 April 1993( Book )

2 editions published in 1993 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Droplet-based microfluidics and engineering of tissue plasminogen activator for biomedical applications by Lucia Granieri( Book )

2 editions published in 2009 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Le phage display est une méthode généralement utilisée pour l'évolution dirigée de protéines, elle permet de produire une immense diversité de variants de protéines exprimés sur la membrane de particules virales. Ces variants de protéines peuvent être sélectionnés soit pour leur affinité de liaison (p. ex. les anticorps) soit pour leur activité catalytique (p.ex. les enzymes). La sélection d'enzymes pour leur activité catalytique requiert néanmoins l'utilisation de substrats et/ou produits immobilisés, ce qui empêche la sélection de protéines sur plusieurs cycles catalytiques. Le but de ce projet de thèse était de développer une méthode nous permettant d'outrepasser ces limites : la compartimentation dans des systèmes microfluidiques de particules virales exprimant des variants de protéines unique sur leur surface. L'encapsulation de ces particules dans des gouttes nous a permit d'utiliser des substrats/produits solubles et donc la sélection pour de multiples cycles catalytiques a été possible. L'utilisation d'un système d'expression mammifère a permit aux protéines de subir les modifications post-traductionnelles (ponts disulfure, glycosylations) nécessaires. Ce système permet de monitorer l'activité enzymatique, de variants de protéines uniques d'une banque, exprimés sur la membrane de particules virales. En plus, nous avons développé un système nous permettant de trier des virus en utilisant comme critère la présence ou l'absence d'activité enzymatique
Development of a two-phase microfluidic platform for drug screening by Jenifer Clausell-Tormos( Book )

2 editions published in 2010 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Nous avons développé une nouvelle technologie de microfluidique en goutte pour le criblage de médicaments. Ce technologie permet la miniaturisation des tests; en particulier, permet une réduction massive des coûts des criblages Uusqu'à 1000 fois) et également l'utilisation d'échantillons de très grande valeur que l'on obtient difficilement à des échelles nécessaires au criblage à haut-débit (cellules primaires). De plus, l'utilisation de petits volumes devrait faciliter les tests à l'échelle de la cellule unique. La première étape de ce projet a été de démontrer que des cellules humaines ou même des organismes multicellulaires peuvent être incubées plusieurs jours dans les gouttes et être récupérées complètement viables. Ensuite, nous avons démontré la coencapsulation de différents composés dans les gouttes, nécessaire pour le criblage de médicaments candidats. En particulier, nous avons développé un système automatisé de génération de micro-compartiments distincts. Pour ce faire, nous avons interfacé un échantillonneur automatique avec notre plateforme microfluidique. Il aspire les composés depuis des plaques de microtitration et les injecte dans une portion de tuyau ou ils sont espacés par de petits volumes d'huile perfluorée dans laquelle les composés sont insolubles. Comme les composés sont encapsulés dans un ordre fixé, leur identité est connue tout au long du test ce qui contourne le problème du marquage des composés pour leur identification. Finalement, nous avons établi de nouveaux tests d'inhibition virale. La combinaison des ces réussites devrait permettre des approches nouvelles pour l'identification de médicaments antiviraux ou de cocktails d'antiviraux
Fluorescent silica nanoparticles for multidimensional barcoding in droplets : towards high-throughput screening in two-phase microfluidics by Victoire Goust( Book )

2 editions published in 2011 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Le criblage à haut débit a connu des avancées significatives en 20 ans. Néanmoins, les technologies microplaque ou microarray ne sont pas toujours optimales. C'est pourquoi de nouvelles plates-formes, basées sur la microfluidique en gouttes, pourraient significativement augmenter le débit et réduire les coûts. Cependant, une fois en dehors de la puce, les gouttes perdent leur information spatiale : il est donc nécessaire de marquer les molécules encapsulées pour les identifier. Nous avons choisi un marquage fluorescent, car cette technique est très utilisée en biologie. Le but de ce travail était de fabriquer un matériau fluorescent compatible avec la microfluidique en gouttes, puis de produire plusieurs banques de gouttes encodées avec ce matériau. Nous avons opté pour des nanoparticules de silice comprenant un fluorophore organique attaché de manière covalente. Notre nouvelle synthèse a produit des particules de 2,5 nm, les plus petites jamais synthétisées. Elles sont plus brillantes que les fluorophores organiques, résistent mieux au photoblanchiment et ont une polarisation modulable. Nous avons ensuite étudié les propriétés de surface des particules, en particulier leur interaction avec le tensioactif. A temps longs, une compétition se produit. De plus, des effets osmotiques ont été mis en évidence, si la concentration en particules varie entre d'une goutte à l'autre. Enfin, nous avons examiné les paramètres majeurs dans l'élaboration du code, les optimisations possibles et des stratégies pour réduire le recouvrement spectral. Nous avons produit des banques de gouttes encodées avec deux et trois couleurs, qui peuvent être utilisées dans de nombreuses applications
PCR digitale pour la détection et la caractérisation de micro-organismes pathogènes au niveau de la cellule unique by Amandine Trouchet( )

1 edition published in 2016 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

We aim to develop a prototype of droplet-based microfluidic system capable of detecting and colocalizing multiple genetic markers at the single cell/bacteria level, using the Polymerase Chain Reaction (PCR) in a digital multiplexed version. This cannot be achieved using current commercial digital PCR systems, and should increase the sensitivity and reliability of the detection of pathogens. Importantly, the system will guarantee the presence of multiple markers within the same genome and enable accurate identification, and bring the false positive rate close to zero. As a first application, we will demonstrate the possibility to co-localize 3 virulence genes in the E.coli strain O157:H7, a major foodborne pathogen, which has to be detected in clinical feces samples or food samples, which may also contain non pathogenic E. coli carrying only a subset of these virulence genes. E. Coli will be encapsulated in micrometric droplets, lysed by heating in situ prior performing a multicolour end-point Taqman assay. Our objective is to demonstrate that this test can be successfully applied to real clinical or food samples
Microdroplets as microreactors for biology and chemistry in microfluidic systems by Ali Fallah-Araghi( )

1 edition published in 2011 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

The compartmentalization of the primordial soup into vesicles is thought to be one of the first steps of the emergence of organized cells. These water-in-oil-in-water droplets provide a linkage between genotype and phenotype. Moreover, through division they provide the possibility for heredity and evolution. By using manmade compartments, in form of bulk water-in-oil emulsions, it is possible to perform directed evolution experiments within the laboratory. These experiments use Darwinian principles comprising iterative cycles of mutation and selection. The bulk emulsions are composed of millions of individual droplets containing one single gene with all the ingredients necessary for the in vitro expression of those genes. The specific phenotype can then be selected under strictly controlled conditions. However, the emulsions created in bulk are highly polydisperse and have specific limitations when used for directed evolution experiments. Due to differences in droplet volumes it is difficult to perform quantitative experiments. Droplet-based microfluidics and in vitro compartmentalization (IVC) can be combined to perform directed evolution experiments. Droplet-based microfluidics produces highly monodisperse emulsions that can be manipulated in a highly controlled manner. By using a set of specific microfluidic devices it is possible to amplify single genes in droplets, to measure their in vitro expression and, in combination with a sorting device isolate the most active variants form a genetic library.
Synthesis of modified peptide nucleic acids by Dalila Chouikhi( )

1 edition published in 2013 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Peptide nucleic acids (PNA) are structural analogs of natural nucleic acids composed of repeating units of N-(2-aminoethyl)-glycine residues linked by peptide bonds. Their chemical and biological stability makes them very suitable for supramolecular assemblies with biological applications such as encoding combinatorial libraries of small molecules and for performing templated reactions. This phD project aimed at the synthesis of modified peptide nucleic acids to enhance their physicochemical and hybridization properties as well as for construction of combinatorial libraries
Pre-evolutionary dynamics in autocatalytic RNA networks by Simon Arsene( )

1 edition published in 2018 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Networks of interdependent molecules are considered plausible candidates for initiating the transition from biology to chemistry. Though they have been intensively scrutinized theoretically, there is still no experimental evidence for confirming or denying their supposed crucial role in the origins of life. In particular, we are still lacking experimental proofs of any of the three ingredients usually presented as required for Darwinian evolution: heredity, variation and selection. A system that would possess the three while being coupled to some sort of encapsulated replication process would theoretically be able to undergo Darwinian evolution. As a matter of fact, this has been shown theoretically for Collectively Autocatalytic Sets (CAS) where each molecule of the set is catalytically formed by another member of the ensemble. Here we use the Azoarcus recombination ribozyme system to experimentally form structurally diverse CASs to explore their evolutionary properties. In this system, the ribozymes can catalyze the assembly of other ribozymes from smaller fragments, present in the food set. We first use a droplet microfluidics set-up coupled with next-generation sequencing to conduct a large scale study on thousands of Azoarcus CASs. We develop a perturbative approach to identify the important topological parameters that control variations in CASs as a result of environmental perturbations, here the addition of a new species. We then determine the small set of network features governing memory of the initial conditions in Azoarcus CAS, a pre-requisite for heredity, by using a computational model validated by experimental data. Finally, we demonstrate that Azoarcus CAS possess catabolic processes which make them robust to perturbations in the food set and thus more prebiotic relevant. These results provide evidence for the crucial role of RNA CASs in the origins of life and illustrate how the network structure can be tailored to obtain CASs with properties interesting from an evolutionary point of view, paving the way to an experimental demonstration of Darwinian evolution with a purely molecular system
Characterizing the antibody response at the single cell level with droplet microfluidics by Carlos Castrillon( )

1 edition published in 2018 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les anticorps sont des protéines en forme de Y, trouvées comme composant du sérum circulant, qui aident le système immunitaire à cibler et à répondre aux agents pathogènes et aux molécules étrangères, mais peuvent aussi contribuer à la maladie en réagissant aux protéines constitutives. Les anticorps sont produits par des Plasmocytes, qui les sécrètent dans la circulation. Parce qu'il n'y a pas de lien physique entre les plasmocytes et leurs anticorps sécrétés, la détection d'anticorps spécifiques d'un antigène est problématique. Dans cette thèse, j'explore l'utilisation de la microfluidique en gouttelettes pour générer et manipuler des compartiments aqueux homogènes dans lesquels des cellules sécrétant anticorps peuvent être isolées et analysées à haut débit a'échelle d'une seule cellule. Pour caractériser les cellules sécrétant des anticorps à l'intérieur des gouttelettes, j'utilise un nouveau test qui permet d'interroger les cellules en fonction de la spécificité de leur sécrétion. Ces compartiments de gouttelettes peuvent être triés pour le séquençage d'anticorps, ou analysés au cours du temps pour obtenir des informations cinétiques de l'interaction anticorps-antigène à l'intérieur de chaque gouttelette. En utilisant une nouvelle technologie, j'ai pu obtenir le répertoire d'anticorps de souris immunisées contre deux antigènes différents à partir de cellules sécrétant des anticorps spécifiques d'un antigène, avec des capacités égales ou supérieures aux technologies disponibles actuelles. Aussi, j'ai pu suivre le processus de maturation d'affinité des anticorps à l'échelle de la cellule unique, à la fois dans l'immunisation et la maladie auto-immune. Avec ces outils, je démontre comment la microfluidique peut être utilisée pour caractériser les réponses immunitaires et auto-immunes à travers l'évaluation de cellules sécrétant des anticorps
Droplet-based microfluidics and engineering of tissue plasminogen activator for biomedical applications by Lucia Granieri( )

1 edition published in 2010 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Le phage display est une méthode généralement utilisée pour l'évolution dirigée de protéines, elle permet de produire une immense diversité de variants de protéines exprimés sur la membrane de particules virales. Ces variants de protéines peuvent être sélectionnés soit pour leur affinité de liaison (p. ex. les anticorps) soit pour leur activité catalytique (p.ex. les enzymes). La sélection d'enzymes pour leur activité catalytique requiert néanmoins l'utilisation de substrats et/ou produits immobilisés, ce qui empêche la sélection de protéines sur plusieurs cycles catalytiques. Le but de ce projet de thèse était de développer une méthode nous permettant d'outrepasser ces limites : la compartimentation dans des systèmes microfluidiques de particules virales exprimant des variants de protéines unique sur leur surface. L'encapsulation de ces particules dans des gouttes nous a permit d'utiliser des substrats/produits solubles et donc la sélection pour de multiples cycles catalytiques a été possible. L'utilisation d'un système d'expression mammifère a permit aux protéines de subir les modifications post-traductionnelles (ponts disulfure, glycosylations) nécessaires. Ce système permet de monitorer l'activité enzymatique, de variants de protéines uniques d'une banque, exprimés sur la membrane de particules virales. En plus, nous avons développé un système nous permettant de trier des virus en utilisant comme critère la présence ou l'absence d'activité enzymatique
Functional assays for screening antibody activity in droplet-based microfluidics by Diana Lieber( )

1 edition published in 2010 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les méthodes de criblage haut-débit sur des cellules nécessitent de petits volumes afin de réduire les coûts et permettre une manipulation rapide des échantillons. En effet, une miniaturisation supplémentaire des technologies classiques de criblage haut-débit en plaques devient problématique à cause de l'évaporation et des forces capillaires. Pour surmonter ces limitations, on a développé des systèmes basés sur la microfluidique en gouttes où des cellules sont cultivées dans des microcompartiments aqueux indépendants entourés d'huile perfluorée inerte. Un tel système permet d'effectuer des analyses automatisées à l'échelle individuelle de chaque compartiment suite à un certain temps d'incubation comme le requiert les tests cellulaires à haut-débit. Nous nous sommes focalisés également sur le développement de tests fonctionnels pour le criblage d'anticorps comme par exemple les anticorps neutralisants le VIH (Virus de l'Immunodéficience Humaine) ou inhibant l'ECA (Enzyme de Conversion de l'Angiotensine). Les approches haut-débit pour la sélection d'anticorps utilisent le « phage display » ou des hybridomes. « Phage display » est une méthode efficace mais permet de sélectionner les anticorps pour leur activité de liaison et non pas de neutralisation. Les hybridomes permettent d'effectuer une sélection en fonction de l'activité neutralisante des anticorps, mais dans cette approche on est limité par le nombre de clones pouvant être sélectionnés. Le but de ce projet était d'établir un nouveau test permettant de sélectionner, au niveau de cellules uniques, des cellules sécrétrices d'anticorps (hybridomes). Ce système pourra être utilisé également pour le criblage de cellules B. Une fois établi, ce système pourrait être utilisé pour le criblage/sélection de beaucoup d'autres anticorps thérapeutiques
In vivo and in vitro directed evolution of enzymes using droplet-based microfluidics by Alexei Godina( )

1 edition published in 2013 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

L'ingénierie des protéines fonctionnelles est un processus d'amélioration des propriétés physiques ou catalytiques d'enzyme au travers d'approches rationnelles et d'évolution dirigée, aussi bien que la combinaison des deux méthodes. Malgré le progrès de la modélisation moléculaire des protéines, les méthodes de prédiction restent aléatoires et un grand nombre de variantes restent à tester. De ce fait, le développement et l'utilisation d'un système de criblage d'activité de protéines à très haut débit, comme la microfluidique en gouttes, est indispensable. Cette thèse de doctorat présente trois projets d'évolution dirigée de protéines en trois approches différentes avec expression d'enzyme in vitro et in vivo. Les plateformes microfluidiques ont été développées et validées pour chaque projet. De plus, plusieurs banques de variants ont été criblées avec, dans certains cas, isolement de molécules 5-10 fois que le clone parental
Fluorescent silica nanoparticles for multidimensional barcoding in droplets towards high-throughput screening in two-phase microfluidics by Victoire Goust( )

1 edition published in 2012 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Le criblage à haut débit a connu des avancées significatives en 20 ans. Néanmoins, les technologies microplaque ou microarray ne sont pas toujours optimales. C'est pourquoi de nouvelles plates-formes, basées sur la microfluidique en gouttes, pourraient significativement augmenter le débit et réduire les coûts. Cependant, une fois en dehors de la puce, les gouttes perdent leur information spatiale : il est donc nécessaire de marquer les molécules encapsulées pour les identifier. Nous avons choisi un marquage fluorescent, car cette technique est très utilisée en biologie. Le but de ce travail était de fabriquer un matériau fluorescent compatible avec la microfluidique en gouttes, puis de produire plusieurs banques de gouttes encodées avec ce matériau. Nous avons opté pour des nanoparticules de silice comprenant un fluorophore organique attaché de manière covalente. Notre nouvelle synthèse a produit des particules de 2,5 nm, les plus petites jamais synthétisées. Elles sont plus brillantes que les fluorophores organiques, résistent mieux au photoblanchiment et ont une polarisation modulable. Nous avons ensuite étudié les propriétés de surface des particules, en particulier leur interaction avec le tensioactif. A temps longs, une compétition se produit. De plus, des effets osmotiques ont été mis en évidence, si la concentration en particules varie entre d'une goutte à l'autre. Enfin, nous avons examiné les paramètres majeurs dans l'élaboration du code, les optimisations possibles et des stratégies pour réduire le recouvrement spectral. Nous avons produit des banques de gouttes encodées avec deux et trois couleurs, qui peuvent être utilisées dans de nombreuses applications
Functional assays for screening antibody activity in droplet-based microfluidics by Diana Lieber( )

1 edition published in 2011 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les méthodes de criblage haut-débit sur des cellules nécessitent de petits volumes afin de réduire les coûts et permettre une manipulation rapide des échantillons. En effet, une miniaturisation supplémentaire des technologies classiques de criblage haut-débit en plaques devient problématique à cause de l'évaporation et des forces capillaires. Pour surmonter ces limitations, on a développé des systèmes basés sur la microfluidique en gouttes où des cellules sont cultivées dans des microcompartiments aqueux indépendants entourés d'huile perfluorée inerte. Un tel système permet d'effectuer des analyses automatisées à l'échelle individuelle de chaque compartiment suite à un certain temps d'incubation comme le requiert les tests cellulaires à haut-débit. Nous nous sommes focalisés également sur le développement de tests fonctionnels pour le criblage d'anticorps comme par exemple les anticorps neutralisants le VIH (Virus de l'Immunodéficience Humaine) ou inhibant l'ECA (Enzyme de Conversion de l'Angiotensine). Les approches haut-débit pour la sélection d'anticorps utilisent le « phage display » ou des hybridomes. « Phage display » est une méthode efficace mais permet de sélectionner les anticorps pour leur activité de liaison et non pas de neutralisation. Les hybridomes permettent d'effectuer une sélection en fonction de l'activité neutralisante des anticorps, mais dans cette approche on est limité par le nombre de clones pouvant être sélectionnés. Le but de ce projet était d'établir un nouveau test permettant de sélectionner, au niveau de cellules uniques, des cellules sécrétrices d'anticorps (hybridomes). Ce système pourra être utilisé également pour le criblage de cellules B. Une fois établi, ce système pourrait être utilisé pour le criblage/sélection de beaucoup d'autres anticorps thérapeutiques
Development of a two-phase microfluidic platform for drug screening by Jenifer Clausell-Tormos( )

1 edition published in 2010 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Nous avons développé une nouvelle technologie de microfluidique en goutte pour le criblage de médicaments. Ce technologie permet la miniaturisation des tests; en particulier, permet une réduction massive des coûts des criblages Uusqu'à 1000 fois) et également l'utilisation d'échantillons de très grande valeur que l'on obtient difficilement à des échelles nécessaires au criblage à haut-débit (cellules primaires). De plus, l'utilisation de petits volumes devrait faciliter les tests à l'échelle de la cellule unique. La première étape de ce projet a été de démontrer que des cellules humaines ou même des organismes multicellulaires peuvent être incubées plusieurs jours dans les gouttes et être récupérées complètement viables. Ensuite, nous avons démontré la coencapsulation de différents composés dans les gouttes, nécessaire pour le criblage de médicaments candidats. En particulier, nous avons développé un système automatisé de génération de micro-compartiments distincts. Pour ce faire, nous avons interfacé un échantillonneur automatique avec notre plateforme microfluidique. Il aspire les composés depuis des plaques de microtitration et les injecte dans une portion de tuyau ou ils sont espacés par de petits volumes d'huile perfluorée dans laquelle les composés sont insolubles. Comme les composés sont encapsulés dans un ordre fixé, leur identité est connue tout au long du test ce qui contourne le problème du marquage des composés pour leur identification. Finalement, nous avons établi de nouveaux tests d'inhibition virale. La combinaison des ces réussites devrait permettre des approches nouvelles pour l'identification de médicaments antiviraux ou de cocktails d'antiviraux
Pre-Hospital Anesthesia Handbook by Andrew Griffiths( )

2 editions published in 2010 in English and held by 0 WorldCat member libraries worldwide

The safe and swift establishment of a secure airway is crucial in the pre-hospital situation, and many pre-hospital systems have developed standard operating procedures that involve inducing anesthesia for airway control. Developed from the manual for a two-day course on the introduction to pre-hospital anesthesia given by the Great North Air Ambulance Service, the Pre-Hospital Anesthesia Handbook details the procedures, drugs and algorithms used by the expert crews of the Great North Air Ambulance. Authored by authorities in both the clinical application and the academic research aspects of pre-hospital anesthesia, it provides a focused, evidence-based foundation for any practitioner who wishes to learn this potentially life-saving procedure
 
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Pre-hospital anaesthesia handbook
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Griffiths, A.D.

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