Schvoerer, Evelyne
Overview
| Works: | 22 works in 24 publications in 1 language and 33 library holdings |
|---|---|
| Roles: | Thesis advisor, Author, Other, Opponent |
Publication Timeline
.
Most widely held works by
Evelyne Schvoerer
Impact des glycoprotéines d'enveloppe E1 et E2 du virus de l'hépatite C sur la réponse au traitement antiviral interféron-a
pégylé/ribavirine chez des patients atteints d'hépatite chronique C by
Rémy Moenne-Loccoz(
)
2 editions published in 2011 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
The standard of care (SOC) treatment, i.e. pegylated interferon-alpha/ribavirin, is efficient in only 50% of patients chronically infected with hepatitis C virus (HCV)-genotype 1. The high variability of HCV E1/E2 envelope glycoproteins may indirectly contribute to viral resistance to treatment by selection of strains with high infectivity and/or increased ability to escape to immunity. This hypothesis was investigated by in silico and in vitro functional analyses (pseudoparticles HCVpp). Molecular signatures (MS) and covariant amino acid minimal networks, defined on E1/E2, were correlated with treatment response. Three out of the four MS which were defined and functionally assessed showed results concordant with the hypothesis. The nonresponse (NR)-related residues 431A and 642V led to a decrease in antibody (Ab)-mediated HCVpp neutralization using patients sera, a 431A or 642V-dependent increase of HCVpp infectivity at the entry step, and a 431A-dependent increase of interaction with CD81 and SR-BI. The response (R)-related residue 219T decreased HCVpp infectivity. Minimal networks of covariant amino acids separated NR-related from R-related strains and included three out of the four MS previously mentioned. Conclusion: Our results support an indirect contribution of HCV E1/E2 to treatment efficacy. NR-related 431A and 642V favour HCVpp infectivity with concomitant escape from neutralizing Ab while R-related 219T decreases HCVpp infectivity, suggesting that virus-host interactions during viral entry may be involved in the SOC treatment failure
2 editions published in 2011 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
The standard of care (SOC) treatment, i.e. pegylated interferon-alpha/ribavirin, is efficient in only 50% of patients chronically infected with hepatitis C virus (HCV)-genotype 1. The high variability of HCV E1/E2 envelope glycoproteins may indirectly contribute to viral resistance to treatment by selection of strains with high infectivity and/or increased ability to escape to immunity. This hypothesis was investigated by in silico and in vitro functional analyses (pseudoparticles HCVpp). Molecular signatures (MS) and covariant amino acid minimal networks, defined on E1/E2, were correlated with treatment response. Three out of the four MS which were defined and functionally assessed showed results concordant with the hypothesis. The nonresponse (NR)-related residues 431A and 642V led to a decrease in antibody (Ab)-mediated HCVpp neutralization using patients sera, a 431A or 642V-dependent increase of HCVpp infectivity at the entry step, and a 431A-dependent increase of interaction with CD81 and SR-BI. The response (R)-related residue 219T decreased HCVpp infectivity. Minimal networks of covariant amino acids separated NR-related from R-related strains and included three out of the four MS previously mentioned. Conclusion: Our results support an indirect contribution of HCV E1/E2 to treatment efficacy. NR-related 431A and 642V favour HCVpp infectivity with concomitant escape from neutralizing Ab while R-related 219T decreases HCVpp infectivity, suggesting that virus-host interactions during viral entry may be involved in the SOC treatment failure
Etude des glycoprotéines d'enveloppe E1 et E2 du virus de l'hépatite C : approche moléculaire de l'impact de ces glycoprotéines
sur la réponse au traitement antiviral interferon pégylé-ribavirine chez des patients atteints d'une hépatite C chronique,
génotype 1 by
Aurélie Velay(
Book
)
1 edition published in 2011 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2011 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Intérêts d'une technique de PCR en temps réel dans le suivi de la virémie du cytomégalovirus chez des patients transplantés
du rein et de moelle osseuse by
Sylvie Pujol(
Book
)
1 edition published in 2005 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2005 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Mise en place et intérêt d'une technique de PCR en temps réel pour la quantification de l'ADN du cytomégalovirus chez
les transplantés d'organe et de moelle osseuse by
Evelyne Goetz(
Book
)
1 edition published in 2006 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2006 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Aspects virologiques de l'infection à VIHen pédiatrie : étude d'une cohorte d'enfants infectés et de la prise en charge
par traitement antirétroviral by
Evelyne Schvoerer(
)
1 edition published in 1995 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 1995 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Charges virales sanguines du virus d' Epstein-Barr quantifiées par PCR en temps réel chez des sujets immunodéprimés :
contraintes techniques et interprétation by
Line Gwenda Guidicelli(
Book
)
1 edition published in 2005 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2005 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Séquençage du virus de l'hépatite B pour génotypage et recherche de mutations de résistance au traitement : mise en place
de la technique et revue de la littérature by
Rébecca Pastor(
Book
)
1 edition published in 2007 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
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Recherche de virus entériques dans des eaux de l'environnement et des prélèvements cliniques par des techniques moléculaires
: place des calicivirus by
Evelyne Schvoerer(
Book
)
2 editions published in 2000 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
2 editions published in 2000 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Apport de la biologie moléculaire pour le diagnostic des infections neuroméningées dues aux Herpesviridae by
Valéry Frechin(
Book
)
1 edition published in 2004 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2004 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Variabilité des quasi-espèces du virus de l'hépatite C après transplantation hépatique pour cirrhose virale C : Mise
en place de la technique d'étude par séquençage après clonage. by
Anne-Catherine Weiss-Renaudin(
Book
)
1 edition published in 2005 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2005 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Séquençage du génome complet des virus des hépatites C et E by
Elodie Laugel(
)
1 edition published in 2020 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Parmi les quatre principaux virus responsables de l'hépatite humaine, le virus de l'hépatite C (VHC) et le virus de l'hépatite E (VHE) sont assez différents tout en partageant des similitudes. Les deux virus peuvent être transmis par le sang ou ses dérivés, tandis que le VHE peut également suivre des voies environnementales ou zoonotiques. Ces virus à ARN très variables peuvent provoquer une hépatite chronique conduisant potentiellement à un hépatocarcinome. Le VHC et le VHE peuvent développer de nouvelles structures et fonctions sous pression sélective, pour s'adapter à l'immunité de l'hôte, aux tissus humains, aux traitements, à divers réservoirs animaux. Par ailleurs, avec des traitements antiviraux à action directe, le VHC peut être éradiqué alors que le VHE est un pathogène émergent sans traitement spécifique. En tant qu'outil moléculaire unique capable d'explorer la plasticité du génome virale, le séquençage complet du génome (FLG) est devenu plus facile, plus rapide et moins cher. La présente revue permettra de montrer comment FLG peut explorer ces virus à ARN dans le but d'enquêter sur des données génomiques clés susceptibles d'améliorer les connaissances de base sur les virus, la prise en charge médicale des patients et les outils de prévention
1 edition published in 2020 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Parmi les quatre principaux virus responsables de l'hépatite humaine, le virus de l'hépatite C (VHC) et le virus de l'hépatite E (VHE) sont assez différents tout en partageant des similitudes. Les deux virus peuvent être transmis par le sang ou ses dérivés, tandis que le VHE peut également suivre des voies environnementales ou zoonotiques. Ces virus à ARN très variables peuvent provoquer une hépatite chronique conduisant potentiellement à un hépatocarcinome. Le VHC et le VHE peuvent développer de nouvelles structures et fonctions sous pression sélective, pour s'adapter à l'immunité de l'hôte, aux tissus humains, aux traitements, à divers réservoirs animaux. Par ailleurs, avec des traitements antiviraux à action directe, le VHC peut être éradiqué alors que le VHE est un pathogène émergent sans traitement spécifique. En tant qu'outil moléculaire unique capable d'explorer la plasticité du génome virale, le séquençage complet du génome (FLG) est devenu plus facile, plus rapide et moins cher. La présente revue permettra de montrer comment FLG peut explorer ces virus à ARN dans le but d'enquêter sur des données génomiques clés susceptibles d'améliorer les connaissances de base sur les virus, la prise en charge médicale des patients et les outils de prévention
Etude de la virulence de Staphylococcus lugdunensis by
Xavier Argemi(
)
1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Staphylococcus lugdunensis est un staphylocoque à coagulase négative qui présente de nombreuses particularités sur le plan clinique et microbiologique. Cette bactérie commensale de la peau est impliquée dans des infections humaines d'une particulière gravité. Ce travail de thèse nous a permis de déterminer que S. lugdunensis présente bien une pathogénicité tout à fait inhabituelle pour un SCN car 37.2% de toutes les souches recueillies entre 2013 et 2016 étaient impliquées dans un processus infectieux. Nous avons aussi observé que les infections ostéo-articulaires en étaient la première manifestation. Nous avons découvert une nouvelle protéase excrétée par 61.7% des souches qui présente une association statistique forte avec les infections ostéo-articulaires. Il s'agit d'une métalloprotéase de 37 kDa que nous avons pu purifier puis séquencer afin de caractériser ses propriétés biochimiques et son environnement génique. Enfin, nous avons aussi réalisé un séquençage de novo de 7 souches de S. lugdunensis et démontrer l'existence de multiples éléments génétiques mobiles
1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Staphylococcus lugdunensis est un staphylocoque à coagulase négative qui présente de nombreuses particularités sur le plan clinique et microbiologique. Cette bactérie commensale de la peau est impliquée dans des infections humaines d'une particulière gravité. Ce travail de thèse nous a permis de déterminer que S. lugdunensis présente bien une pathogénicité tout à fait inhabituelle pour un SCN car 37.2% de toutes les souches recueillies entre 2013 et 2016 étaient impliquées dans un processus infectieux. Nous avons aussi observé que les infections ostéo-articulaires en étaient la première manifestation. Nous avons découvert une nouvelle protéase excrétée par 61.7% des souches qui présente une association statistique forte avec les infections ostéo-articulaires. Il s'agit d'une métalloprotéase de 37 kDa que nous avons pu purifier puis séquencer afin de caractériser ses propriétés biochimiques et son environnement génique. Enfin, nous avons aussi réalisé un séquençage de novo de 7 souches de S. lugdunensis et démontrer l'existence de multiples éléments génétiques mobiles
Réémergence virale épidémique : coxsackievirus A6 et entérovirus A71, de la maladie pied-main-bouche aux atteintes neurologiques by
Stéphanie Tomba Ngangas(
)
1 edition published in 2021 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Enteroviruses (EVs) are enteric viruses assigned to the Picornaviridae family and classified into four taxonomic species (A to D). Symptomatic EV infections can be associated with diseases of the nervous system, lung, heart, muscle, and skin. Hand-foot-and-mouth disease (HFMD) is characterized by a rash and oral ulcerations in children under 5 years. Enterovirus A71 (EVA71) and coxsackievirus A6 (CVA6) are the two most frequent EV types of species A reported in HFMD cases. In France, EVA71 was associated with an increasing number of neurological diseases since 2016, and CVA6 was associated with regular HFMD outbreaks. The main aim of the thesis is to investigate and compare the epidemic reemergences of these two viruses by using whole-genome analysis. The outbreak of neurological diseases in 2016 was associated with the virus C1v2015 assigned to the EVA71 subgenogroup C1, which emerged in 2010. This virus has a chimeric genome characterized by multiple recombination events. Compared with the genomes of the earlier C1 viruses, the C1v2015 genome displays characteristic changes within epitopes exposed at the capsid surface. The recombination event that changed in 2013 the 3Dpol gene occurred shortly before the epidemic spread in Europe in 2015. To investigate CVA6, we designed a whole-genome amplification technique and used high throughput sequencing to determine viral genomes in buccal specimens collected in France between 2010 and 2018. We did not find major variations in structural genes, but we identified five recombinant forms not previously reported by the study of the 3Dpol gene. Paralleling the worldwide shifts, the clinical and epidemiological features of HFMD cases reported in France indicated the epidemic reemergence of CVA6 was contemporaneous of the increasing frequency of an atypical disease. To conclude, our data highlight the value of whole-genome analysis to compare molecular variations and trace the evolutionary and epidemic histories of reemerging enteroviruses
1 edition published in 2021 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Enteroviruses (EVs) are enteric viruses assigned to the Picornaviridae family and classified into four taxonomic species (A to D). Symptomatic EV infections can be associated with diseases of the nervous system, lung, heart, muscle, and skin. Hand-foot-and-mouth disease (HFMD) is characterized by a rash and oral ulcerations in children under 5 years. Enterovirus A71 (EVA71) and coxsackievirus A6 (CVA6) are the two most frequent EV types of species A reported in HFMD cases. In France, EVA71 was associated with an increasing number of neurological diseases since 2016, and CVA6 was associated with regular HFMD outbreaks. The main aim of the thesis is to investigate and compare the epidemic reemergences of these two viruses by using whole-genome analysis. The outbreak of neurological diseases in 2016 was associated with the virus C1v2015 assigned to the EVA71 subgenogroup C1, which emerged in 2010. This virus has a chimeric genome characterized by multiple recombination events. Compared with the genomes of the earlier C1 viruses, the C1v2015 genome displays characteristic changes within epitopes exposed at the capsid surface. The recombination event that changed in 2013 the 3Dpol gene occurred shortly before the epidemic spread in Europe in 2015. To investigate CVA6, we designed a whole-genome amplification technique and used high throughput sequencing to determine viral genomes in buccal specimens collected in France between 2010 and 2018. We did not find major variations in structural genes, but we identified five recombinant forms not previously reported by the study of the 3Dpol gene. Paralleling the worldwide shifts, the clinical and epidemiological features of HFMD cases reported in France indicated the epidemic reemergence of CVA6 was contemporaneous of the increasing frequency of an atypical disease. To conclude, our data highlight the value of whole-genome analysis to compare molecular variations and trace the evolutionary and epidemic histories of reemerging enteroviruses
Caractérisation moléculaire de souches du virus de l'hépatite E chez des patients suivis au CHRU de Nancy by
Alexis Gentilhomme(
)
1 edition published in 2020 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Le virus de l'hépatite E (VHE) est largement distribué dans le monde et provoque des manifestations cliniques variées. Les objectifs de ce travail étaient d'identifier des signatures moléculaires impliquées dans le pouvoir pathogène et/ou la transmission du virus et d'étudier certaines propriétés virales in vitro. Le séquençage haut débit a permis d'analyser la quasi-espèce virale sur 25 échantillons provenant de 19 patients suivis au CHRU de Nancy ou de Dijon. La zone génomique virale choisie, chevauchement ORF2/3, confère des fonctions majeures au VHE. Certaines séquences d'acides aminés ont été identifiées, permettant d'émettre des hypothèses sur la circulation du VHE et son pouvoir pathogène. Une approche expérimentale a aussi permis de mettre en évidence le rôle de la pseudo-enveloppe virale sur la capacité d'adhésion du VHE sur une surface hydrophobe
1 edition published in 2020 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Le virus de l'hépatite E (VHE) est largement distribué dans le monde et provoque des manifestations cliniques variées. Les objectifs de ce travail étaient d'identifier des signatures moléculaires impliquées dans le pouvoir pathogène et/ou la transmission du virus et d'étudier certaines propriétés virales in vitro. Le séquençage haut débit a permis d'analyser la quasi-espèce virale sur 25 échantillons provenant de 19 patients suivis au CHRU de Nancy ou de Dijon. La zone génomique virale choisie, chevauchement ORF2/3, confère des fonctions majeures au VHE. Certaines séquences d'acides aminés ont été identifiées, permettant d'émettre des hypothèses sur la circulation du VHE et son pouvoir pathogène. Une approche expérimentale a aussi permis de mettre en évidence le rôle de la pseudo-enveloppe virale sur la capacité d'adhésion du VHE sur une surface hydrophobe
Dynamique de la circulation des Entérovirus de l'homme à l'environnement : Etude par séquençage haut débit by
Maxime Bisseux(
)
1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Les entérovirus (EV) sont des Picornavirus (virus nus à génome ARN positif), caractérisés par une grande diversité génétique et antigénique (116 types classés en 4 espèces taxonomiques EV-A à D) et une évolution rapide. Les infections humaines sont très fréquentes, hautement contagieuses à partir des selles et épidémiques. La plupart des infections sont asymptomatiques ou bénignes ; elles peuvent être graves voire mortelles, en particulier chez les jeunes enfants. La poliomyélite, modèle d'infection à EV, est en voie d'éradication grâce aux programmes de vaccination et de surveillance sous l'égide de l'OMS. La détection de poliovirus sauvages dans des pays déclarés exempts de polio depuis plusieurs années et l'émergence récente de plusieurs EV non poliomyélitiques (EV-A71, EV-D68) associés à des manifestations cliniques sévères dans plusieurs régions du monde montrent l'importance de surveiller la circulation des EV dans la population humaine. Le but de la thèse était de rechercher et caractériser les EV dans les eaux usées de l'agglomération de Clermont-Ferrand et de comparer les données à celles de la surveillance clinique pour avoir une image plus complète de la circulation virale dans la population générale. Une méthode de concentration virale à partir des eaux usées prélevées en entrée (eaux usées brutes) et sortie (eaux usées traitées) de station d'épuration a été mise au point, permettant la détection moléculaire des EV et de 6 autres virus entériques humains. La présence de génomes viraux a été détectée dans tous les échantillons d'octobre 2014 à octobre 2015, avec une médiane de 6 virus différents en entrée de station et de 4 virus en sortie. L'analyse phylogénétique des séquences d'EV et des virus des hépatites A et E présents dans les eaux usées et les prélèvements cliniques des patients hospitalisés au CHU de Clermont-Ferrand pendant la même période, a validé l'approche mise en place pour surveiller la circulation communautaire d'un virus entérique. La diversité des EV présents dans les eaux usées brutes a été analysée par séquençage d'amplicons avec une technique haut débit Illumina (metabarcoding). Les résultats montrent la présence d'une grande diversité d'EV et la circulation silencieuse de 25 types (notamment 9 EV-C, dont des séquences de poliovirus 1 vaccinal) dans la population générale. L'analyse phylogénétique des variants intra-typiques a mis en évidence plusieurs profils épidémiques parmi les principaux types ayant circulé pendant la période d'étude. Les données obtenues montrent la faisabilité et la sensibilité de la stratégie développée pour détecter et caractériser les EV présents dans les eaux usées. Ils permettent de discuter la place de la surveillance environnementale dans la surveillance des infections à EV non polio (études épidémiologiques, prévention des épidémies, alertes sanitaires). Surveiller conjointement les virus entériques dans l'environnement et chez les patients permet une meilleure compréhension de leur prévalence. Cette approche globale de la circulation virale et de l'écologie de la santé représente un engagement important de la part des laboratoires et nécessitera une intégration dans des réseaux structurés de collaboration nationales et internationales dépassant la seule surveillance des EV
1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Les entérovirus (EV) sont des Picornavirus (virus nus à génome ARN positif), caractérisés par une grande diversité génétique et antigénique (116 types classés en 4 espèces taxonomiques EV-A à D) et une évolution rapide. Les infections humaines sont très fréquentes, hautement contagieuses à partir des selles et épidémiques. La plupart des infections sont asymptomatiques ou bénignes ; elles peuvent être graves voire mortelles, en particulier chez les jeunes enfants. La poliomyélite, modèle d'infection à EV, est en voie d'éradication grâce aux programmes de vaccination et de surveillance sous l'égide de l'OMS. La détection de poliovirus sauvages dans des pays déclarés exempts de polio depuis plusieurs années et l'émergence récente de plusieurs EV non poliomyélitiques (EV-A71, EV-D68) associés à des manifestations cliniques sévères dans plusieurs régions du monde montrent l'importance de surveiller la circulation des EV dans la population humaine. Le but de la thèse était de rechercher et caractériser les EV dans les eaux usées de l'agglomération de Clermont-Ferrand et de comparer les données à celles de la surveillance clinique pour avoir une image plus complète de la circulation virale dans la population générale. Une méthode de concentration virale à partir des eaux usées prélevées en entrée (eaux usées brutes) et sortie (eaux usées traitées) de station d'épuration a été mise au point, permettant la détection moléculaire des EV et de 6 autres virus entériques humains. La présence de génomes viraux a été détectée dans tous les échantillons d'octobre 2014 à octobre 2015, avec une médiane de 6 virus différents en entrée de station et de 4 virus en sortie. L'analyse phylogénétique des séquences d'EV et des virus des hépatites A et E présents dans les eaux usées et les prélèvements cliniques des patients hospitalisés au CHU de Clermont-Ferrand pendant la même période, a validé l'approche mise en place pour surveiller la circulation communautaire d'un virus entérique. La diversité des EV présents dans les eaux usées brutes a été analysée par séquençage d'amplicons avec une technique haut débit Illumina (metabarcoding). Les résultats montrent la présence d'une grande diversité d'EV et la circulation silencieuse de 25 types (notamment 9 EV-C, dont des séquences de poliovirus 1 vaccinal) dans la population générale. L'analyse phylogénétique des variants intra-typiques a mis en évidence plusieurs profils épidémiques parmi les principaux types ayant circulé pendant la période d'étude. Les données obtenues montrent la faisabilité et la sensibilité de la stratégie développée pour détecter et caractériser les EV présents dans les eaux usées. Ils permettent de discuter la place de la surveillance environnementale dans la surveillance des infections à EV non polio (études épidémiologiques, prévention des épidémies, alertes sanitaires). Surveiller conjointement les virus entériques dans l'environnement et chez les patients permet une meilleure compréhension de leur prévalence. Cette approche globale de la circulation virale et de l'écologie de la santé représente un engagement important de la part des laboratoires et nécessitera une intégration dans des réseaux structurés de collaboration nationales et internationales dépassant la seule surveillance des EV
Interactions Norovirus-Hôte au cours de Maladies Inflammatoires Chroniques de l'Intestin by
Georges Tarris(
)
1 edition published in 2021 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Les Maladies Inflammatoires Chroniques de l'Intestin (MICI) touchent plus de 200.000 patients en France, et comprennent la maladie de Crohn (MC) qui affecte tout l'appareil digestif, et la rectocolite hémorragique (RCH), uniquement le côlon et le rectum. L'étiologie de ces affections impliquerait des facteurs génétiques, immunologiques et microbiologiques, le rôle des virus restant à élucider. Parmi ceux-ci, les norovirus humains sont la principale cause de gastro-entérites virales. L'attachement des norovirus à la paroi intestinale s'effectue par le biais des antigènes tissulaires de groupe sanguin (ABH(O) et Lewis). L'expression de ces antigènes varie en fonction du tissu et de l'état physiologique ou pathologique. Chez la personne saine, l'expression de ces antigènes se fait exclusivement dans l'intestin grêle et dans une moindre mesure dans le côlon proximal. L'objectif de la thèse a été de déterminer l'expression de ces antigènes et les profils d'accroche des VLP sur des tissus inflammatoires de 24 patients souffrant de MC et de RCH lors de poussées inflammatoires et de tissus sains et inflammatoires de 17 patients non-sécréteurs (1 patient souffrant de MC et 16 patients sains). Nous avons donc cherché à démontrer l'expression des HBGA selon le phénotype « sécréteur » (expression ABH(O), Leb, Ley) ou « non sécréteur » (expression Lea, Lex), de patients sains et atteints de MICI, et à définir le rôle de ces antigènes dans l'accroche des norovirus en utilisant des particules virales de synthèse (VLP) dérivées de norovirus humains. Les expériences d'accroche de VLP GII.4 (génotype prédominant dans le monde), réalisées sur des tissus provenant de pièces opératoires de MICI, prouvent la reconnaissance des VLP sur les tissus inflammatoires du grêle (MC) et du colon (MC et RCH). Sur ces muqueuses inflammatoires colique et rectale des patients sécréteurs et non-sécréteurs, nous avons observé une surexpression des antigènes Lea et Lex sur les muqueuses régénératives, que ce soit sous leur forme sialylée (sLea et sLex) ou non-sialylée. Nous avons ainsi démontré que l'accroche spécifique des VLP sur ces muqueuses inflammatoires se faisait par le biais de l'antigène Lea et dans une moindre mesure Lex et cela en l'absence des antigènes ABH(O), pas ou peu exprimées par les zones régénératives. Chez les individus non-sécréteurs sains de l'étude, nous avons également observé la suppression de l'attachement des VLP par des anticorps monoclonaux spécifiques de l'antigène Lea démontrant encore une fois son implication dans l'attachement des norovirus humains, sur la muqueuse intestinale saine de ces sujets. Nous avons enfin observé que l'accroche des norovirus variait également en fonction des tissus étudiés et du génotype de norovirus (GII.4, GII.3 et GII.17 dans le cadre de l'étude), chez les sujets sécréteurs ou non-sécréteurs. A l'aune de nos travaux, les zones inflammatoires régénératives ont donc la capacité d'interagir spécifiquement avec les norovirus par le biais principalement de Lea. Il en découle probablement des perturbations du système immunitaire induites par l'accroche du norovirus. Ces mécanismes inflammatoires provoqués par l'attachement du norovirus et probablement d'autres virus entériques donne un nouvel éclairage sur les infections virales chez les patients MICI. Ces mécanismes restent cependant à élucider d'un point de vue physiopathologique. D'autres travaux seront également nécessaires pour évaluer l'incidence des infections à norovirus et plus généralement des virus entériques chez ces patients
1 edition published in 2021 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Les Maladies Inflammatoires Chroniques de l'Intestin (MICI) touchent plus de 200.000 patients en France, et comprennent la maladie de Crohn (MC) qui affecte tout l'appareil digestif, et la rectocolite hémorragique (RCH), uniquement le côlon et le rectum. L'étiologie de ces affections impliquerait des facteurs génétiques, immunologiques et microbiologiques, le rôle des virus restant à élucider. Parmi ceux-ci, les norovirus humains sont la principale cause de gastro-entérites virales. L'attachement des norovirus à la paroi intestinale s'effectue par le biais des antigènes tissulaires de groupe sanguin (ABH(O) et Lewis). L'expression de ces antigènes varie en fonction du tissu et de l'état physiologique ou pathologique. Chez la personne saine, l'expression de ces antigènes se fait exclusivement dans l'intestin grêle et dans une moindre mesure dans le côlon proximal. L'objectif de la thèse a été de déterminer l'expression de ces antigènes et les profils d'accroche des VLP sur des tissus inflammatoires de 24 patients souffrant de MC et de RCH lors de poussées inflammatoires et de tissus sains et inflammatoires de 17 patients non-sécréteurs (1 patient souffrant de MC et 16 patients sains). Nous avons donc cherché à démontrer l'expression des HBGA selon le phénotype « sécréteur » (expression ABH(O), Leb, Ley) ou « non sécréteur » (expression Lea, Lex), de patients sains et atteints de MICI, et à définir le rôle de ces antigènes dans l'accroche des norovirus en utilisant des particules virales de synthèse (VLP) dérivées de norovirus humains. Les expériences d'accroche de VLP GII.4 (génotype prédominant dans le monde), réalisées sur des tissus provenant de pièces opératoires de MICI, prouvent la reconnaissance des VLP sur les tissus inflammatoires du grêle (MC) et du colon (MC et RCH). Sur ces muqueuses inflammatoires colique et rectale des patients sécréteurs et non-sécréteurs, nous avons observé une surexpression des antigènes Lea et Lex sur les muqueuses régénératives, que ce soit sous leur forme sialylée (sLea et sLex) ou non-sialylée. Nous avons ainsi démontré que l'accroche spécifique des VLP sur ces muqueuses inflammatoires se faisait par le biais de l'antigène Lea et dans une moindre mesure Lex et cela en l'absence des antigènes ABH(O), pas ou peu exprimées par les zones régénératives. Chez les individus non-sécréteurs sains de l'étude, nous avons également observé la suppression de l'attachement des VLP par des anticorps monoclonaux spécifiques de l'antigène Lea démontrant encore une fois son implication dans l'attachement des norovirus humains, sur la muqueuse intestinale saine de ces sujets. Nous avons enfin observé que l'accroche des norovirus variait également en fonction des tissus étudiés et du génotype de norovirus (GII.4, GII.3 et GII.17 dans le cadre de l'étude), chez les sujets sécréteurs ou non-sécréteurs. A l'aune de nos travaux, les zones inflammatoires régénératives ont donc la capacité d'interagir spécifiquement avec les norovirus par le biais principalement de Lea. Il en découle probablement des perturbations du système immunitaire induites par l'accroche du norovirus. Ces mécanismes inflammatoires provoqués par l'attachement du norovirus et probablement d'autres virus entériques donne un nouvel éclairage sur les infections virales chez les patients MICI. Ces mécanismes restent cependant à élucider d'un point de vue physiopathologique. D'autres travaux seront également nécessaires pour évaluer l'incidence des infections à norovirus et plus généralement des virus entériques chez ces patients
Impact des glycoprotéines d'enveloppe E1 et E2 du virus de l'hépatite C sur la réponse au traitement antiviral interféron-a
pégylé/ribavirine chez des patients atteints d'hépatite chronique C by
Rémy Moenne-Loccoz(
)
1 edition published in 2013 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Le traitement de référence composé d'interféron-alpha pégylé/ribavirine n'est efficace que chez 50% des patients chroniquement infectés par un virus de l'hépatite C (VHC)-génotype 1. La haute variabilité des glycoprotéines d'enveloppe E1/E2 du VHC pourrait indirectement contribuer à la résistance virale au traitement par la sélection de souches avec un potentiel infectieux (p.i) élevé et/ou une capacité accrue à échapper à l'immunité. Cette hypothèse a été évaluée in silico puis par analyses fonctionnelles in vitro (pseudoparticules HCVpp). Des signatures moléculaires (SM) et des réseaux minimaux d'acides aminés (aa) covariants, définis sur E1/E2, étaient corrélés à la réponse au traitement. Trois des quatre SM définies et fonctionnellement évaluées montraient des résultats en accord avec l'hypothèse. Les résidus 431A et 642V liés à la non-réponse (NR) entraînaient une diminution de la neutralisation des HCVpp par les anticorps (Ac) circulant dans le sérum de patients, une augmentation 431A- ou 642V-dépendante du p.i. des HCVpp à l'étape d'entrée dans les cellules, et une interaction augmentée avec CD81 et SR-BI via 431A. Le résidu 219T lié à la réponse (R) diminuait le p.i des HCVpp. Des réseaux d'aa covariants séparaient les souches NR des souches R et comportaient 3 des 4 SM citées plus haut. Conclusion : Nos résultats sont en faveur d'une contribution indirecte de E1/E2 du VHC à l'efficacité du traitement. Les résidus 431A et 642V (NR) favorisent le p.i des HCVpp et un échappement aux Ac neutralisants alors que le résidu 219T (R) diminue le p.i, suggérant que les interactions virus-hôte durant l'entrée virale peuvent intervenir dans l'échec du traitement anti-VHC
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Le traitement de référence composé d'interféron-alpha pégylé/ribavirine n'est efficace que chez 50% des patients chroniquement infectés par un virus de l'hépatite C (VHC)-génotype 1. La haute variabilité des glycoprotéines d'enveloppe E1/E2 du VHC pourrait indirectement contribuer à la résistance virale au traitement par la sélection de souches avec un potentiel infectieux (p.i) élevé et/ou une capacité accrue à échapper à l'immunité. Cette hypothèse a été évaluée in silico puis par analyses fonctionnelles in vitro (pseudoparticules HCVpp). Des signatures moléculaires (SM) et des réseaux minimaux d'acides aminés (aa) covariants, définis sur E1/E2, étaient corrélés à la réponse au traitement. Trois des quatre SM définies et fonctionnellement évaluées montraient des résultats en accord avec l'hypothèse. Les résidus 431A et 642V liés à la non-réponse (NR) entraînaient une diminution de la neutralisation des HCVpp par les anticorps (Ac) circulant dans le sérum de patients, une augmentation 431A- ou 642V-dépendante du p.i. des HCVpp à l'étape d'entrée dans les cellules, et une interaction augmentée avec CD81 et SR-BI via 431A. Le résidu 219T lié à la réponse (R) diminuait le p.i des HCVpp. Des réseaux d'aa covariants séparaient les souches NR des souches R et comportaient 3 des 4 SM citées plus haut. Conclusion : Nos résultats sont en faveur d'une contribution indirecte de E1/E2 du VHC à l'efficacité du traitement. Les résidus 431A et 642V (NR) favorisent le p.i des HCVpp et un échappement aux Ac neutralisants alors que le résidu 219T (R) diminue le p.i, suggérant que les interactions virus-hôte durant l'entrée virale peuvent intervenir dans l'échec du traitement anti-VHC
Etude des propriétés génétiques et fonctionnelles des variants du virus de l'hépatite C lors d'évènements de transmission by
Thibault Guinoiseau(
)
1 edition published in 2018 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
Chez un individu infecté, le VHC circule sous la forme d'une population de variants viraux appelés quasi-espèce. Lors d'un évènement de transmission, certains variants viraux sont préférentiellement transmis et un effondrement de la diversité virale chez l'individu nouvellement infecté est souvent observé. Les propriétés électives de ces variants ainsi que leur rôle dans l'évolution clinique sont méconnus. L'objectif de cette étude est d'identifier si des déterminants moléculaires situés au niveau des glycoprotéines d'enveloppe du VHC sont associés à une plus grande capacité de transmission. Les propriétés fonctionnelles des variants transmis et non transmis seront étudiées, en particulier la sensibilité à la neutralisation autologue. Les échantillons étudiés proviennent de couples mère-enfant infectés chroniquement par le VHC issus de d'un essai clinique réalisé en Thaïlande. La composition des populations virales au sein de 3 paires a été étudiée à l'aide d'une technique d'amplification après dilution limite (SGA) suivie d'un séquençage profond (Illumina). Le variant majoritaire chez la mère était retrouvé majoritaire chez l'enfant pour les paires 1 et 3. Pour 2 paires (2 et 3), une moindre diversité génétique a été observée chez l'enfant par rapport à la mère témoignant d'un goulot d'étranglement génétique lors de la transmission. Après clonage des gènes E1E2, des tests d'infectivité sur cellules hépatocytaires ainsi que des tests de neutralisation par le sérum maternel sont réalisés avec le modèle de rétrovirus pseudotypés (VHCpp). Pour la 1ère paire, le variant majoritaire chez la mère (variant transmis à l'enfant) est infectieux et résistant au sérum autologue. Pour la deuxième paire, le variant minoritaire (transmis) est légèrement résistant à la neutralisation autologue. Un variant majoritaire non transmis apparait sensible à la neutralisation autologue. Des études complémentaires en système de virus réplicatifs issus de la culture cellulaire (VHCcc) sont en cours. Au final, les résultats de cette étude contribuent à comprendre les étapes précoces de l'infection par le VHC, afin de mieux appréhender de futures approches immunoprophylactiques ou vaccinales
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Chez un individu infecté, le VHC circule sous la forme d'une population de variants viraux appelés quasi-espèce. Lors d'un évènement de transmission, certains variants viraux sont préférentiellement transmis et un effondrement de la diversité virale chez l'individu nouvellement infecté est souvent observé. Les propriétés électives de ces variants ainsi que leur rôle dans l'évolution clinique sont méconnus. L'objectif de cette étude est d'identifier si des déterminants moléculaires situés au niveau des glycoprotéines d'enveloppe du VHC sont associés à une plus grande capacité de transmission. Les propriétés fonctionnelles des variants transmis et non transmis seront étudiées, en particulier la sensibilité à la neutralisation autologue. Les échantillons étudiés proviennent de couples mère-enfant infectés chroniquement par le VHC issus de d'un essai clinique réalisé en Thaïlande. La composition des populations virales au sein de 3 paires a été étudiée à l'aide d'une technique d'amplification après dilution limite (SGA) suivie d'un séquençage profond (Illumina). Le variant majoritaire chez la mère était retrouvé majoritaire chez l'enfant pour les paires 1 et 3. Pour 2 paires (2 et 3), une moindre diversité génétique a été observée chez l'enfant par rapport à la mère témoignant d'un goulot d'étranglement génétique lors de la transmission. Après clonage des gènes E1E2, des tests d'infectivité sur cellules hépatocytaires ainsi que des tests de neutralisation par le sérum maternel sont réalisés avec le modèle de rétrovirus pseudotypés (VHCpp). Pour la 1ère paire, le variant majoritaire chez la mère (variant transmis à l'enfant) est infectieux et résistant au sérum autologue. Pour la deuxième paire, le variant minoritaire (transmis) est légèrement résistant à la neutralisation autologue. Un variant majoritaire non transmis apparait sensible à la neutralisation autologue. Des études complémentaires en système de virus réplicatifs issus de la culture cellulaire (VHCcc) sont en cours. Au final, les résultats de cette étude contribuent à comprendre les étapes précoces de l'infection par le VHC, afin de mieux appréhender de futures approches immunoprophylactiques ou vaccinales
Influence de la variabilité des protéines d'enveloppe du virus de l'hépatite B sur l'évolution de l'infection évaluée
par la persistance de l'antigène HBs by
Marine Eschlimann(
)
1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
L'hépatite B chronique touche environ 257 millions de personnes dans le monde. La perte de l'antigène HBs (AgHBs), marqueur de guérison fonctionnelle, n'est que très rarement observée, même sous traitement antiviral (3-16 %). Les protéines d'enveloppe du virus de l'hépatite B (VHB), formant l'AgHBs, sont très variables et cruciales pour le pouvoir infectieux du virus de l'hépatite B (VHB) et la physiopathologie. Nous avons émis l'hypothèse que cette variabilité pourrait expliquer, au moins partiellement, l'évolution de l'infection par le VHB, évaluée par la clairance de l'AgHBs, chez des patients traités ou non par analogues nucléos(t)idiques anti-VHB. Chez 29 patients infectés par différents génotypes du VHB (A, C et D), présentant différents profils cliniques (infection aigüe ou chronique, co-infection VHB/VIH) et thérapeutiques, une très grande variabilité des protéines d'enveloppe du VHB a été mise en évidence. Chez ces patients, la persistance de l'AgHBs était corrélée avec la présence de mutations et délétions localisées dans des régions des protéines d'enveloppe virale jouant un rôle important dans la reconnaissance du virus par le système immunitaire. Ces résultats renforcent l'hypothèse que l'étude des protéines d'enveloppe du VHB pourrait mettre en évidence des signatures moléculaires influençant le fitness du VHB et par conséquent l'évolution clinique de la maladie liée à l'infection par le VHB
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L'hépatite B chronique touche environ 257 millions de personnes dans le monde. La perte de l'antigène HBs (AgHBs), marqueur de guérison fonctionnelle, n'est que très rarement observée, même sous traitement antiviral (3-16 %). Les protéines d'enveloppe du virus de l'hépatite B (VHB), formant l'AgHBs, sont très variables et cruciales pour le pouvoir infectieux du virus de l'hépatite B (VHB) et la physiopathologie. Nous avons émis l'hypothèse que cette variabilité pourrait expliquer, au moins partiellement, l'évolution de l'infection par le VHB, évaluée par la clairance de l'AgHBs, chez des patients traités ou non par analogues nucléos(t)idiques anti-VHB. Chez 29 patients infectés par différents génotypes du VHB (A, C et D), présentant différents profils cliniques (infection aigüe ou chronique, co-infection VHB/VIH) et thérapeutiques, une très grande variabilité des protéines d'enveloppe du VHB a été mise en évidence. Chez ces patients, la persistance de l'AgHBs était corrélée avec la présence de mutations et délétions localisées dans des régions des protéines d'enveloppe virale jouant un rôle important dans la reconnaissance du virus par le système immunitaire. Ces résultats renforcent l'hypothèse que l'étude des protéines d'enveloppe du VHB pourrait mettre en évidence des signatures moléculaires influençant le fitness du VHB et par conséquent l'évolution clinique de la maladie liée à l'infection par le VHB
Etude du leucotropisme du virus de l'hépatite C par caractérisation des quasi-espèces virales dans la région hypervariable
1 de la glycoprotéine virale d'enveloppe E2 sur le modèle de la transplantation hépatique. by
Frédéric Schramm(
Book
)
1 edition published in 2008 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
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- Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008) Degree grantor
- Université de Strasbourg (2009-....). Degree grantor
- Université de Lorraine Degree grantor
- Université Bordeaux-II (1971-2013) Degree grantor
- Moenne-Loccoz, Rémy (1983 -....). Author
- Gaudy-Graffin, Catherine (19..-....). Other Opponent Thesis advisor
- École doctorale BioSE - Biologie, Santé, Environnement Other
- Velay, Aurélie Author
- Lafon, Marie-Edith Thesis advisor
- Pujol, Sylvie (1976-....). Author
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