60f Ferrer i Prats, Albert [WorldCat Identities]
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Ferrer i Prats, Albert

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Most widely held works by Albert Ferrer i Prats
Caracterización de las HMG-CoA reductasa quinasas de citosol y microsomas de hígado de rata : estudio cinético de su activación por nucleótidos by Albert Ferrer i Prats( Book )

3 editions published between 1986 and 1987 in Spanish and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

Aproximació als mecanismes moleculars implicats en la regulació de la síndrome de fugida de l'ombra en Arabidopsis by Marçal Gallemí Rovira( Book )

3 editions published between 2013 and 2014 in Catalan and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

La llum és un element essencial per les plantes, ja que d'ella en treuen l'energia necessària per créixer. És normal doncs que hagin adquirit mecanismes per percebre diferents paràmetres d'aquesta, relacionats tant amb la seva quantitat com amb la qualitat. Dels diferents receptors de llum o fotoreceptors, els fitocroms són els més estudiats. Probablement la resposta controlada pels fitocroms més important per a les plantes a la naturalesa és la síndrome de fugida de l'ombra (SAS, de l'anglès shade avoidance syndrome). Aquesta síndrome agrupa una sèrie de respostes que han adoptat les plantes amb flors per evitar l'ombra de la vegetació propera. Tals respostes, com l'allargament de l'hipocòtil, la disminució de l'expansió foliar o la floració primerenca, impliquen a la fi una disminució de la biomassa en general. L'estudi de la SAS, per tant, es perfila com de gran interès biotecnològic, i ha estat objecte de la manipulació genètica per tal de millorar el rendiment dels cultius. En la present tesi s'ha treballat amb dos factors prèviament identificats al laboratori i involucrats en les respostes de la SAS. 1. Estudi de la relació estructura-funció del factor regulador de la SAS ATHB4. D'una banda s'ha estudiat el factor de transcripció ATHB4, una proteïna de la família HD-Zip (de l'anglès homeodomain-leucine zipper) classe II. La sobre-expressió d'ATHB4 produeix plàntules més petites i fosques, amb hipocòtil lleugerament allargat i cotiledons estrets, i respostes molt menors a tractaments d'ombra. Mitjançant la sobre-expressió de diferents regions d'ATHB4 s'ha vist que proteïnes sense la regió Ct mantenen la mateixa activitat biològica que la sobre-expressió de la proteïna sencera, suggerint que la regió Ct no té rellevància en les respostes a ombra aplicada al laboratori. D'altra banda, línies sobre-expressant diverses parts d'ATHB4 sense la regió Nt, o amb mutacions en residus conservats d'aquesta, perden gran part del fenotip visible en la línia sobre-expressora d'ATHB4 sencera, suggerint que aquesta regió Nt és essencial per l'activitat d'ATHB4 en les respostes a ombra. A més, formes truncades d'ATHB4 que podrien tenir la capacitat d'unió al DNA afectada mantenen les mateixes respostes a ombra que la proteïna sencera, suggerint que ATHB4 podria actuar en ombra de manera independent a la unió al DNA. Conjuntament, els resultats fisiològics i moleculars de les diferents construccions analitzades en la present tesi, suggereixen que la regió Nt d'ATHB4 podria interaccionar amb altres proteïnes per tal de regular les respostes de la SAS. 2. Paper de les nucleoporines (NUPs) en la regulació de la SAS. En un escrutini genètic es va obtenir el mutant recessiu dracula2 (dra2) amb una resposta a ombra simulada atenuada. Aquesta mutació afecta un gen que codifica una possible NUP. L'al·lel obtingut de l'escrutini es va anomenar dra2-1. En la present tesi s'ha realitzat una caracterització general d'aquest mutant, i d'altres al·lels mutants del mateix gen per inserció de T-DNA, mitjançant quantificacions dels nivells de pigments (clorofil·les i carotenoides), respostes a hormones (BRs, GAs i auxines) i respostes a ombra, tant fisiològiques com moleculars. S'ha vist que aquest mutant presenta alteracions en diverses respostes, inclosa l'exportació d'mRNAs del nucli cap al citoplasma. A més, altres NUPs també afecten les respostes de la SAS a nivell fisiològic, però dra2-1 és l'únic amb efectes moleculars. En conjunt, en la present tesi presentem les NUPs com a elements importants per les correctes respostes de la SAS, tenint DRA2 algun paper específic en la senyalització per llum
Regulación de las respuestas a la proximidad vegetal en Arabidopsis thaliana y especies afines by María José Molina Contreras( Book )

2 editions published in 2017 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

El síndrome de huida de la sombra (Shade Avoidance Syndrome, SAS) se refiere al conjunto de respuestas de las plantas desencadenadas por la detección de la disminución de la razón entre luz roja (R) y roja lejana (FR) de la radiación incidente (razón R:FR). Esta razón, que indica la proximidad de vegetación que puede competir por los recursos, es percibida por los fotorreceptores fitocromos y pone en marcha las respuestas del SAS, entre las que se encuentra el aumento del alargamiento del hipocotilo. Entre los componentes reguladores del SAS en Arabidopsis thaliana se encuentra ATHB4, cuya expresión se induce rápidamente tras la percepción de proximidad vegetal. ATHB4 es un factor de transcripción de la familia HD-Zip II que actúa como un represor transcripcional. Resultados previos del laboratorio indicaron que (1) ATHB4 tiene un mecanismo molecular dual, actuando como un cofactor transcripcional en la regulación SAS en la plántula y como un factor de transcripción en el control de la polaridad de las hojas, y (2) el dominio Nt es una región implicada en la interacción con otras proteínas que es necesaria para las dos actividades indicadas de ATHB4. Para profundizar en los mecanismos moleculares de ATHB4, hemos sobreexpresado en plantas transgénicas ATHB4 fusionado al activador transcripcional VP16 (35S:ATHB4-VP16). De estos experimentos se confirmó que ATHB4 actúa como cofactor transcripcional en el control del alargamiento del hipocotilo en respuesta a la proximidad vegetal, mientras que actúa como factor de transcripción en la regulación de la polaridad foliar. Por otro lado, realizamos dos aproximaciones complementarias para identificar interactores del Nt de ATHB4, lo que permitió identificar a TOPLESS (TPL), TPL-RELATED 4 (TPR4), SEUSS (SEU) y SIN3 ASSOCIATED POLYPEPTIDE P18 (SAP18). En contraste con A. thaliana, Cardamine hirsuta, un especie filogenéticamente próxima, no responde a la proximidad vegetal alargando sus hipocotilos, es decir, tolera la sombra. Los análisis comparativos de las respuestas a la proximidad vegetal nos llevó a generar plantas de C. hirsuta con niveles reducidos de PHYA (35S:RNAi-ChPHYA), que en A. thaliana se ha descrito como un regulador negativos del SAS. Las plantas 35S:RNAi-ChPHYA resultaron en plántulas con capacidad de responder a la sombra simulada. En paralelo, realizamos un cribado genético que nos llevó a la identificación y caracterización de plántulas mutantes en C. hirsuta con una respuesta a la sombra en hipocotilo restaurada (mutantes sis, slender in shade). Los dos mutantes eran recesivos y alélicos (sis1-1 y sis1-2) y nos llevaron a determinar que SIS1 codifica el gen ChPHYA. La complementación de plantas deficientes en phyA de A. thaliana con las construcciones pPHYA:PHYA and pPHYA:SIS1 nos indicó que las proteínas PHYA y SIS1 tienen diferentes actividades. En resumen, nuestros resultados indican que la tolerancia a la sombra en C. hirsuta requiere la actividad de phyA, que actuaría suprimiendo la respuesta de alargamiento del hipocotilo. En resumen, nuestros resultados indican que la tolerancia a la sombra en C. hirsuta requiere mecanismos de supresión, y que phyA formaría parte de éstos
The structure and function of maize scutellum during early stages of germination by Hédia Tnani( Book )

2 editions published in 2012 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Estructura y función del escutelo de maíz durante las primeras etapas de la germinación. Durante la germinación, las células epiteliales del escutelo sufren una elongación que aumenta la superficie de contacto entre el endospermo y el embrión y facilita el transporte de los nutrientes del endospermo al embrión. La elongación de las células del escutelo es inhibida por ABA y ácido salicílico, pH básico y ácido y altas concentraciones de sorbitol. Las giberelinas exógenas estimulan la elongación, pero una reducción en la síntesis de giberelinas o percepción no la inhiben. La elongación es inhibida por la sacarosa, pero no la glucosa. Los inhibidores de la transcripción y traducción reducen el alargamiento de las células escutelares, lo que indica que la transcripción y la traducción son necesarias para el proceso de alargamiento. Se identificaron 30 genes que muestran una expresión diferencial significativa en las células epiteliales del escutelo de un día después de la imbibición. Las funciones de un 43% de estos genes no se conoce, el 27% de ellos están involucrados en los procesos metabólicos, el 13% en la síntesis o la transformación de proteínas y el 7% en la estructura celular. ZmPTR1 codifica un transportador de maíz péptido no ha sido previamente caracterizado, se expresa predominantemente en el epitelio escutelar durante la germinación. ZmPTR1 se expresa también en menor medida en la radícula y del hipocotilo. La proteína ZmPTR1 se localiza en el tonoplasto y es homóloga a las otras proteínas transportadoras de di-y tripéptidos AtPTR2, AtPTR4 y AtPTR6 de Arabidopsis thaliana. ZmPTR1 es capaz de transportar al menos el dipéptido Ala-Ala. El análisis proteómico de las proteínas asociadas a los cuerpos lipídicos en escutelo de maíz durante la germinación ha permitido la identificación de, además de proteínas previamente caracterizadas asociadas OB, otras proteínas de funciones diversas. El Análisis cuantitativo subproteómico de los cambios relacionados con los cuerpos lipídicos en el escutelo de maíz entre semillas secas y semillas 2 dias después de la germinación permitieron la identificación de nuevas proteínas que interactúan con los cuerpos lipídicos en las semillas secas o en la germinación de las semillas
Caracterització molecular de proteïna fosfatases de tipus X d'Arabidopsis thaliana by Gemma Pujol Perpiñà( Book )

2 editions published in 1997 in Catalan and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Metabolisme lipídic en plantes : caracterització de la dehidrodoliquildifosfat sintasa 1 i de les proteïnes Arv d' Arabidopsis Thaliana by Oriol Forés del Ruste( Book )

2 editions published between 2007 and 2008 in Catalan and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Identificación de interactores del regulador de la homeostasis lipídica AtArv1 : caracterización del factor de transcripción anclado a membrana maMYB de Arabidopsis by Daniel Caudepón Giménez( Book )

2 editions published between 2014 and 2015 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Estudi de l'especialització funcional dels isoenzims citosòlics de la farnesildifosfat sintasa d'Arabidopsis thaliana by Marta Closa Calvo( Book )

2 editions published between 2007 and 2008 in Catalan and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Caracterització molecular de proteïna fosfatases de tipus 2A d'Arabidopsis thaliana : estudi de l'expressió dels gens PP2A-3 i PP2A-4 by Encarna Pérez Callejón( Book )

2 editions published in 1996 in Catalan and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Caracterización funcional de un nuevo factor bHLH de Zea mays by Agnese Rabissi( Book )

2 editions published in 2014 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

La sequía es el factor más limitante para el crecimiento de las plantas y el acido abscísico (ABA) es la principal fito-hormona involucrada en la respuesta al estrés hídrico. El núcleo de señalización está formado por: los receptores de ABA PYR/PYL/RCAR, las proteínas fosfatasas de tipo C grupo A (PP2Cs) y las proteínas quinasas de tipo SnRK2 /OST1. Trabajos realizados en nuestro laboratorio permitieron caracterizar una proteína quinasa SnRK2 en maíz, la ZmOST1, que complementa el mutante de pérdida de función de Arabidopsis (ost1-2) en la respuesta a sequía. Realizando un cribado de doble híbrido en levadura, en el que se utilizó ZmOST1 como anzuelo frente a una librería de cDNAs de hoja joven de maíz deshidratada, se identificó un factor de transcripción (TF) de tipo bHLH entre los posibles interactores de la quinasa. En este trabajo se detallan los resultados obtenidos en la caracterización molecular y funcional de este TF denominado ZmKS (kinase substrate) y las diferencias funcionales de sus dos isoformas que se han denominado ZmKS1 y ZmKS2. El estudio del patrón de transcripción muestra que ZmKS se expresa en hoja y raíz de maíz así como en embrión y radícula en plantas transgénicas de Arabidopsis portadoras del promotor ZmKS fusionado a GUS. El patrón de expresión de las dos isoformas indica que los niveles de transcritos de ZmKS2 son más elevados que los detectados para ZmKS1 y que responden de forma similar a distintos tratamientos de estrés: para ambos, con ABA la cantidad de RNA aumenta en hoja y también en raíz con NaCl. Hemos averiguado que ZmKS es una proteína nuclear capaz de homo- y hetero-dimerizár y que interacciona preferentemente con una secuencia de DNA E-box like de 7 bp, como corresponde a un factor de transcripción del tipo bHLH. ZmKS1 y ZmKS2 presentan residuos fosforilables por la quinasa OST1 que son específicos de cada isoforma y ambas son directamente fosforiladas por ZmOST1 in vivo e in vitro. Las dos isoformas interaccionan en planta con ZmOST1 a través del dominio osmótico y/o ABA de la kinasa, esta interacción es nuclear para ZmKS1 mientras para ZmKS2 se localiza en núcleo y citoplasma. Análisis funcionales han revelado que la sobre-expresión de ZmKS en Arabidopsis determina un retraso en la germinación que es dependiente de fosforilación y del tratamiento con ABA. Las plantas transgénicas de ambas isoformas presentan una mayor apertura estomática y una respuesta mayor a la fusicoccina. Sin embargo la regulación estomática en estas plantas no depende de fosforilación. Los ensayos de tolerancia a la desecación tanto en plantas transgénicas de maíz como de Arabidopsis sobre-expresando ZmKS2 presentan una tasa mayor de pérdida de agua: este efecto diferencial de las dos isoformas en las plantas transgénicas sugiere un importante papel regulador del gen ZmKS en la tolerancia a la desecación. ZmKS se autoregularía tanto por splicing diferencial alterando las cantidades relativas de cada isoforma ZmKS1y ZmKS2 como mediante la fosforilación/defosforilación de las mismas
Identification and functional characterization of P1N-PISPO, a new gene product present in sweet potato potyviruses by Ares Mingot Martí( Book )

2 editions published in 2016 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Sweet potato feathery mottle virus (SPFMV) (Potyvirus genus, Potyviridae family) causes important yield losses in sweet potato crops, in particular in co-infections with the unrelated crinivirus Sweet potato chlorotic stunt virus (SPCSV). This thesis addresses the characterization of some novel aspects in the infectious cycle of SPFMV, such as the expression, production and function of a new gene product named P1N-PISPO. A better understanding of SPFMV genome organization and the functions of their gene products might be relevant to improve the control strategies against this virus and the associated diseases in sweet potato crops. The positive-sense RNA genome of SPFMV contains a large ORF, translatable as a polyprotein yielding a set of functional mature gene products (P1, HCPro, P3, 6K1, CI, 6K2, VPg-Nla, Nlb and CP), and a short ORF named PIPO in the -1 frame, embedded within the P3 region. In addition to this organization, common to all the members of the Potyvirus genus, another ORF named PISPO was predicted in the genome. PISPO is in the -1 frame within the P1 region of SPFMV and other related potyviruses, starting at a conserved G1_2A6_7 motif, similar to the motif found upstream of PIPO. The expression of PISPO during SPFMV viral infection could result in the production of a putative new gene product P1N-PISPO. In the present work, the presence of the PISPO frame has been investigated in a Spanish isolate of SPFMV infecting Ipomoea batata plants. The genome sequence of this isolate has been assembled from NGS data, showing that the expected trans-framed PISPO sequences is present, preceded by a G2A6 motif. A specific analysis of the NGS data has revealed a significant proportion of transcripts with an extra A in the motif at the beginning of PISPO, as well as a lower proportion of transcripts with an extra in the corresponding conserved motif preceding the PIPO region. These results have demonstrated that a polymerase slippage mechanism could generate transcripts containing extra A residues (G2A7) to allow the translation of P1N-PISPO and P3N-PIPO gene products. Analysis of the viral gene products present in SPFMV infected plant tissues has been performed using LC-MS/MS after separation in SDS- PAGE, focusing in products> 50KDa. Peptides corresponding to the P1 protein have been detected from both the N-terminal portion (11 different peptides, 39% coverage), before the frameshifting signal and therefore common for P1 and P1N-PISPO, and in the C- terminal part (2 peptides exclusive for P1, 10% coverage). Interestingly, four peptides exclusive of PISPO, in its unique ORF (21.3% coverage), have been also found. These results have confirmed that both products P1 and P1N-PISPO are expressed and coexisted during SPFMV infection. Furthermore, transient expression of SPFMV gene products coagroinfiltrated with a reporter gene in Nicotiana benthamiana have revealed that P1N-PISPO acts as an RNA silencing suppressor, a role normally associated with HCPro in other potyviruses. Moreover, mutation of WG/GW motifs present in P1N-PISPO abolished its silencing suppression activity, suggesting that the function might require interaction with Argonaute components of the silencing machinery, as was shown for other viral suppressors. Altogether, the results of this thesis have confirmed the expression of P1N-PISPO during SPFMV infection and they have revealed a polymerase slippage mechanism as the responsible of P1N-PISPO production. Our results also have demonstrated the role of P1N-PISPO as a RNA silencing suppressor
Análisis molecular del polimorfismo del complejo principal de histocompatibilidad en humanos by Albert Morante Vera( )

1 edition published in 2004 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Estudio de la regulación transcripcional en el desarrollo vascular el papel de los receptores de brasinoesteroides y los factores de transcripción R2R3-MYB by Jorge Enrique Salazar Henao( Book )

2 editions published in 2013 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Este proyecto se enfoca en el estudio del desarrollo vascular, analizando la regulación de los receptores de brasinoesteroides y el papel de los factores de transcripción R2R3-MYB en la modulación de la pared celular secundaria. Los brasinoesteroides (BRs) son hormonas vegetales cuya percepción ocurre en la membrana plasmática por el receptor BRI1 y que presentan roles esenciales en el crecimiento y desarrollo de la planta. Los receptores AtBRL3 y AtBRL1, han sido identificados como homólogos a BRI1, capaces de unir con alta afinidad brasinolido (BL), que es el compuesto más activo de los BRs. En este estudio se demostró que los brasinoesteroides regulan el patrón de expresión en el tejido vascular de AtBRL3 y que dicha regulación es dosis dependiente. En la región 5' de AtBRL3 fue identificado un elemento de respuesta a BRs (BRRE) y seguidamente, se estableció que la proteína BES1 que tiene afinidad por las cajas BRRE se une in vivo a la zona donde se encuentra. Los resultados genéticos y moleculares muestran que la expresión de AtBRL3 es promovida a concentraciones bajas de BRs o de la proteína BES1 y reprimida y/o alterada a concentraciones altas de la proteína BES1. De otra parte, esta investigación se orientó también al análisis de la modulación de la biosíntesis de lignina, que es un polímero que se localiza en la pared celular secundaria. La lignina es el segundo polímero más abundante de la biomasa vegetal, después de la celulosa, sin embargo es un componente no deseable para el uso de la biomasa para la alimentación animal y para la producción de bioetanol celulósico, ya que dificulta la destrucción de los polímeros de la pared celular y por tanto, la obtención de los azúcares que la integran (Zhong and Ye, 2009). Este hecho ha aumentado la relevancia de estudiar la ruta de la síntesis de lignina. Una de las familias de factores de trascripción que se ha descrito que son importantes en la ruta de la síntesis de lignina, son los R2R3-MYB. Los R2R3-MYB forman una familia multigénica muy amplia, dentro de la cual se encuentra el subgrupo 4, que se ha descrito que es importante en la represión de la biosíntesis de lignina. En este proyecto se estudio la regulación de la ruta de la síntesis de lignina por parte de los factores de transcripción R2R3-MYB del subgrupo cuatro ZmMYB11, ZmMYB31 y ZmMYB42, identificando in vivo sus dianas y generando con dichos resultados un perfil de unión a ADN, que indica que probablemente cada uno hace parte de un mecanismos de modulación de la producción de diferentes monolignoles. Posteriormente, con el fin de profundizar en el análisis de los mecanismo de modulación en los que están involucrados estos factores de transcripción se identificó y caracterizo un modulo regulatorio presente en el promotor de ZmCOMT, en cuya regulación está involucrado ZmMYB11 y ZmZIM91 que es un miembro de la familia TIFY que ha sido involucrada en respuestas a diversas hormonas como JA y ABA. Los resultado obtenidos permitieron establecer que ZmMYB11 y ZmZIM91 pueden formar un heterodímero que interactúa con el modulo regulatorio en cis AC-GATA/C de ZmCOMT con el fin de reprimir su expresión pero en presencia de metil jasmonato reducen su capacidad de unión al promotor de esta diana
Biosíntesi d'isoprenoides en plantes: caracterització molecular de la farnesildifosfat sintasa d'Arabidopsis thaliana by Núria Cunillera i Segarra( Book )

2 editions published between 1999 and 2008 in Catalan and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Biosíntesis de carotenoides en "Escherichia coli" y en tejidos no fotosintéticos de "Arabidopsis thaliana" by Antía Rodríguez Villalón( Book )

2 editions published in 2010 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Genome-wide transposon analyses annotation, movement and impact on plant function and evolution by Elizabeth Marie Hénaff( Book )

2 editions published in 2013 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

The diversity of life forms around us is astounding: a walk in the woods, or even down the street, shows us organisms of different morphologies: two legs, four legs, wings; different capacity of interaction with our environment: plants photosynthesizing while bacteria break down our garbage. How can life take on so many forms? While there is some increase of genes when comparing the most simple eukaryotes to the most complex ones it is clear that organism complexity is not the result of the number of genes. Therefore is has been postulated that the complexity of an organism arises from the complexity of its gene regulation, rather than the number of genes. This regulation must come then from the non-gene part of the genome. We now know that genes constitute but a small portion of genomes, (about 5% of the human genome). The advent of whole-genome sequencing has enabled us to get a more complete picture of what is in a genome, and with that has come the surprise that a significant part of all genomes characterized is constituted of transposable elements (TEs). Transposable elements are mobile genetic sequences, meaning that they have the capacity to change their position within the genome of a single cell. The goal of my dissertation has been to investigate the role of TEs in plants and their impact on gene and genome evolution. For this I have taken two approaches. The first is a study in the newly sequenced genome of Cucumis melo, an important crop plant in Spain. In the context of this project I have characterized the transposon landscape in the genome, and identified TE related polymorphisms between seven different varieties. This project has of interest the fact that this is an important plant for agriculture and domestication is a particularly relevant evolutionary context in which to study the impact of transposons, as the lines analyzed come from different geographic and selection backgrounds. In the context of this project I have developed a pipeline for genome annotation, and a software for detection of polymorphisms using next-generation paired-end sequencing data. This yielded insight into the dynamics of transposon evolution in this genome, and the selective forces that have shaped the transposon landscape. To our knowledge this is the first analysis that uses polymorphic TEs to investigate differential chromosomal distribution of recent and old transposons, and thus revealing at an intra-species scale the timeline of selection. The results obtained are promising for studying the contribution of mobile elements to the evolution of two genetically similar yet phenotypically different cultivated varieties. In order to study the impact of transposition on gene regulation, I investigated MITE families which have amplified a transciption factor binding site (TF BS) in the model plant Arabidopsis thaliana. This project focuses on the potential impact on gene regulation networks of the redistribution of this TFBS, a phenomenon that has been described for various master TF in animals but not yet to my knowledge in plants. This study combines in silico analysis with molecular data such as microarrays and ChIP, and is a striking example of one of the many manners in which TEs can impact gene regulation. The work in this dissertation highlights the contradictory nature of transposable elements: on one hand, they are invasive, and on the other, are the source of essential innovations. Here we provide insight as to the functions they play in plant genome evolution
Caracterización de ZmXTH1, una nueva xiloglucano endotransglucosilasa-hidrolasa en maiz by Valeria Genovesi( Book )

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Canalización de precursores hacia la biosíntesis de isoprenoides plastídicos en Arabidopsis thaliana by M. Águila Ruiz Sola( Book )

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Los isoprenoides constituyen la familia de metabolitos funcional y estructuralmente más diversa que se conoce. Se encuentran en todos los organismos aunque son especialmente abundantes y diversos en el reino vegetal, donde desempeñan papeles fundamentales en el metabolismo primario y secundario de las plantas. Derivan de un precursor común el isopentenil difosfato (IPP). La condensación de tres moléculas de IPP y una de su isómero dimetilalil difosfato (DMAPP) catalizada por la enzima geranilgeranil difosfato (GGPP) sintasa (GGPPS) genera GGPP, un compuesto precursor de isoprenoides plastídicos como carotenoides, giberelinas, plastoquinonas y la cadena fitol de clorofilas, tocoferoles y filoquinonas. El genoma de Arabidopsis thaliana presenta doce genes codificantes para proteínas con homología a GGPPS, de los cuales sólo diez codifican proteínas con actividad GGPP sintasa. Siete isoformas presentan localización plastídica, dos se encuentran en el retículo endoplasmático y una en la mitocondria. De los genes codificantes, sólo tres presentan un patrón de expresión ubicuo, mientras que el resto se expresan en tejidos y estadios de desarrollo muy concretos. Estos resultados sugieren que diferentes isoformas de GGPPS podrían estar asociadas a la formación de isoprenoides específicos. El primer objetivo de esta tesis fue investigar si en la célula vegetal existe una canalización de precursores (GGPP) hacia la síntesis de grupos concretos de isoprenoides, y en concreto hacia la síntesis de carotenoides. De las 10 isoformas de Arabidopsis, nuestra investigación se ha centrado en la isoforma GGPPS11 por ser la única plastídica de expresión ubicua, alta en tejidos fotosintéticos e inducible por luz, aspectos imprescindibles para estar relacionada con la síntesis de carotenoides. El análisis de tres mutantes de inserción de T-DNA ha revelado que esta isoforma es esencial en la síntesis de isoprenoides y que no presenta redundancia génica con el resto de la familia. La pérdida total de función GGPPS11 es letal y las semillas homocigotas del alelo ggpps11-3 se abortan como consecuencia de un bloqueo en los primeros estadios del desarrollo embrionario. En el mutante ggpps11-2 el T-DNA está insertado en la secuencia codificante del péptido de tránsito a plastos. Hemos demostrado que se traduce una proteína más corta cuya actividad se ejerce fuera del plasto permitiendo el correcto desarrollo embrionario y dando lugar a plántulas albinas incapaces de desarrollar hojas verdaderas como consecuencia de la ausencia de isoprenoides plastídicos. Por último, el mutante ggpps11-4 de pérdida parcial de función presenta un fenotipo de plantas más pequeñas y pálidas con una reducción del 20% en los niveles de carotenoides, clorofilas, tocoferoles y plastoquinonas, lo que permite concluir que esta isoforma está involucrada en la síntesis de la mayoría de los isoprenoides plastídicos derivados del GGPP. Además hemos demostrado que GGPPS11 puede interaccionar con varias enzimas que transforman el GGPP en los primeros intermediarios de las rutas que producen estos isoprenoides plastídicos, las enzimas fitoeno sintasa (PSY) hacia carotenoides, geranilgeranil reductasa (GGR) hacia clorofilas y tocoferoles y solanesil difosfato sintasa (SPPS2) hacia plastoquinonas. Proponemos que estas interacciones estarían facilitando la canalización de GGPP hacia las correspondientes rutas biosintéticas. El segundo objetivo de esta tesis fue analizar la canalización del flujo metabólico hacia la síntesis de carotenoides precursores del ABA en respuesta al estrés salino. Hemos demostrado que el único gen codificante para PSY en Arabidopsis se induce específicamente en la raíz después de un estrés salino para aumentar el flujo hacia la síntesis de carotenoides y que el estrés salino también provoca una inducción de los genes codificantes para las enzimas que sintetizan los precursores carotenoides ([beta], [beta]-xantofilas) del ácido abscísico (ABA) reconduciendo el flujo de la vía hacia la síntesis de la hormona
Metabolismo lipídico en "Arabidopsis thaliana" caracterización de mutantes "arv" y de las isoenzimas farnesildifosfato sintasa citosólicas by Ana Verónica Beatriz Keim( Book )

2 editions published in 2012 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Los estudios realizados sobre las proteínas Arv indican que estaría involucrada en la regulación de la homeostasis de esteroles y esfingolípidos. En levadura se observó una posible función en la síntesis de GPI (Kajiwara et al., 2008) y respecto a su topología, posee 3 dominios hidrofóbicos con el extremo N-terminal orientado hacia el citosol (Villasmil y Nickels 2011). En plantas, se caracterizaron los genes AtARV1 y AtARV2 de Arabidopsis thaliana que codifican dos proteínas de RE funcionales, AtArv1 y AtArv2. Estas comparten una identidad del 66% entre sí y poseen un dominio N-terminal AHD muy conservado en diferentes especies. Ambos genes poseen patrones solapantes de expresión en tejidos meristemáticos, excepto en hojas donde AtARV2 no se expresa (Forés et al., 2006). En este trabajo se determinó que AtArv1 posee un número par de dominios hidrofóbicos y que los extremos N- y C-terminales están orientados hacia el citosol. Además, se caracterizaron mutantes simples con pérdida de función (arv1) y dobles (arv1:arv2), que si bien no mostraron alteraciones fenotípicas, la activación de un RNAi en los doble mutantes arv1:arv2 indica que la pérdida de AtArv produce alteraciones fenotípicas en plántulas, que presentan acortamiento de la raíz y de los cotiledones que se vuelven amarillentos y se curvan en forma de " punta de flecha ". Los niveles de esteroles disminuyen y se ven incrementadas algunas BECL (Bases Esfingoides de Cadena Larga). Por otro lado, AtArv1 no parece estar vinculada a la UPR (Unfolded Protein Response) y su pérdida no es capaz de activar esta respuesta. La farnesildifosfato sintasa (FPS) es una enzima dimérica que cataliza la condensación de una molécula de dimetilalildifosfato con dos moléculas de isopentenildifosfato para dar lugar a farnesildifosfato, que es el punto de partida para la síntesis de isoprenoides en el citosol y las mitocondrias. Los genes FPS1 y FPS2 de Arabidopsis thaliana codifican las isoenzimas FPS1L mitocondrial), FPS1S y FPS2. Las secuencias aminoacídicas de FPS1S y FPS2 poseen una identidad del 90.6% y difieren en sólo 32 aminoácidos. El gen FPS1 se expresa de forma generalizada durante todo el desarrollo de la planta, en cambio, FPS2 muestra un patrón de expresión restringido a órganos florales, semillas y estadios tempranos de la germinación. En la caracterización de los mutantes nulos de Arabidopsis fps1 y fps2 se observó que el gen FPS2 es más importante en las semillas y las etapas tempranas de la germinación. La isoenzima FPS2 contribuye entre un 70-80% a la actividad FPS total en semillas maduras. Como consecuencia, las semillas del mutante fps2 presentan niveles reducidos de sitosterol, un aumento de la actividad HMG-CoA reductasa (HMGR) e hipersensibilidad a la mevastatina (Closa et al., 2010). En este trabajo se ha determinado mediante ensayos bioquímicos, que la isoenzima FPS2 es catalíticamente más eficiente, más sensible al efecto inhibitorio del NaCl, y termodinámicamente más estable que FPS1S. También se ha demostrado la localización citosólica de ambas isoenzimas. Los patrones de expresión de los genes FPS1 y FPS2 son complementarios en semilla e indican que el FPP necesario para el desarrollo de las semillas tiene dos posibles orígenes separados en el espacio y en el tiempo. Por último, los estudios de complementación funcional en semillas del mutante fps2 demuestran que en condiciones normales FPS1S y FPS2 son funcionalmente intercambiables
Regulació gènica de proteïnes de reserva en cereals : factors de transcripció implicats by Elisabet Gas Pascual( Book )

2 editions published between 2006 and 2007 in Catalan and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

 
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Albert Ferrer wetenschapper

Ferrer Prats, Alberto

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