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Investigations fonctionnelles de l'ARN régulateur SprB exprimé par S. aureus : Implications dans les réseaux de régulations généraux de la bactérie

Staphylococcus aureus, pathogène opportuniste de l'Homme, est un réel problème de santé publique du fait de l'émergence de souches virulentes résistantes à différentes classes d'antibiotiques. La compréhension des mécanismes moléculaires impliqués dans sa virulence est indispensable pour la mise au point de nouveaux agents anti-infectieux. Il est apparu récemment que certains ARN régulateurs (ARNrég) de S. aureus sont impliqués dans l'expression de facteurs de virulence. Mon projet de thèse a porté sur l'étude d'un ARNrég de fonction inconnue, SprB. Des expériences préliminaires à ce travail ont montré une variation du niveau d'expression de la protéine SasG en absence de l'ARN SprB. Dans une première partie de ce travail, j'ai cherché à confirmer expérimentalement le lien entre l'ARN SprB et la protéine SasG. Les niveaux d'expression de la protéine SasG ont été observés dans différents contextes génétiques mutants pour SprB et/ou différents facteurs de régulation de S. aureus. L'ensemble des résultats obtenus suggère le rôle indirect de SprB sur l'expression de SasG. SprB semble impliqué dans un réseau global de régulations qui gouverne l'expression de la protéine SasG. La deuxième partie de cette étude qui porte sur l'identification des cibles directes de SprB a été appréhendée à l'aide d'outils prédictifs. Parmi les cibles potentielles révélées par ce criblage in silico, notre intérêt s'est porté sur la sous-unité Opp4F du transporteur ABC Opp4. J'ai montré que l'ARN SprB empêche, in vitro, la fixation du ribosome sur l'ARN Opp4F et diminuerait potentiellement la synthèse de la sous unité Opp4F. Cela pourrait avoir un impact dans la régulation du métabolisme énergétique de S. aureus. L'ensemble de ces résultats suggère une implication de l'ARN SprB dans plusieurs processus physiologiques de S. aureus aussi cruciaux que la régulation de l'expression de gènes de virulence et le métabolisme énergétique de la bactérie
Computer Program, French, 2013