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Etude structurale des protéines et des acides nucléiques par RMN : étude de la répression du gène de la [beta]-lactamase chez B. licheniformis 749/I : Augmentation de la résolution des spectres RMN multidimensionnels par filtrage Hadamard

Author: Hélène Van Melckebeke; Jean-Pierre Simorre; Université Joseph Fourier (Grenoble).
Publisher: 2005.
Dissertation: Thèse de doctorat : Physique : Grenoble 1 : 2005.
Edition/Format:   Thesis/dissertation : Thesis/dissertation : Manuscript   Archival Material : French
Summary:
La RMN est une méthode de choix pour la détermination de la structure tridimensionnelle des protéines et des acides nucléiques en solution. Cependant, la taille des systèmes que l'on peut étudier actuellement par RMN est limitée. Dans la première partie de ce travail, la structure du répresseur BlaI de la beta-lactarnase de B. licheniformis 749/1 et son interaction avec l'ADN ont été étudiées par RMN
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Additional Physical Format: Etude structurale des protéines et des acides nucléiques par RMN : étude de la répression du gène de la [beta]-lactamase chez B. licheniformis 749/I : Augmentation de la résolution des spectres RMN multidimensionnels par filtrage Hadamard / Hélène Van Melckebeke
Villeurbanne : [CCSD], 2006
(ABES)227712854
Material Type: Thesis/dissertation, Manuscript
Document Type: Book, Archival Material
All Authors / Contributors: Hélène Van Melckebeke; Jean-Pierre Simorre; Université Joseph Fourier (Grenoble).
OCLC Number: 863811439
Description: 1 vol. (168 p.) : ill. ; 30 cm.
Responsibility: Hélène Van Melckebeke ; sous la direction de Jean-Pierre Simorre.

Abstract:

La RMN est une méthode de choix pour la détermination de la structure tridimensionnelle des protéines et des acides nucléiques en solution. Cependant, la taille des systèmes que l'on peut étudier actuellement par RMN est limitée. Dans la première partie de ce travail, la structure du répresseur BlaI de la beta-lactarnase de B. licheniformis 749/1 et son interaction avec l'ADN ont été étudiées par RMN avec des méthodes classiques. Ces résultats ont permis de mieux caractériser la répression des gènes de plusieurs mécanismes de résistance aux antibiotiques, incluant la résistance à la méthicilline de la souche pathogène S. aureus. Le deuxième volet de ce travail concerne l'implémentation de filtres Hadamard qui augmentent la résolution des spectres dans certaines expériences de RMN multidimensionnelle. Ces filtres permettent de séparer les pics de corrélation des protéines et des acides nucléiques selon le type d'acide aminé et le type de base, respectivement. Ces développements ouvrent de nouveaux horizons vers l'étude de macromolécules biologiques de plus grosse taille par RMN.

Liquid state NMR is a method of choice for the determination of three-dimensional structure of proteins and nucleic acids. The size of molecules that can be studied nowadays with NMR is however limited. ln the tirst part ofthis work, the structure of the beta-lactarnase repressor Bla! ofB. licheniformis 749/1 and its interaction with DNA have been studied with standard NMR methods. These results provide new insights about the mechanisms of genes repression involved in bacterial resistance to antibiotics, including the methicillin resistance observed for the highly pathogen S. aureus strain. The second part ofthis manuscript concerns the implementation oftwo new Hadamard filters that enhance the resolution ofspectra in certain multidimensional NMR experiments. These filters allow to separate the correlation peaks of proteins and nucleic acids according to the aminoacid type and to the base type, respectively. This opens the way for the study oflarger biological macromolecules by NMR.

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