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Modifications métaboliques et structurelles des communautés de bactéries marines exposées à différentes qualités de matière organique Preview this item
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Modifications métaboliques et structurelles des communautés de bactéries marines exposées à différentes qualités de matière organique

Author: Marine BlanchetFabien JouxSilvio PantojaUniversité Pierre et Marie Curie (Paris / 1971-2017).Universidad de Concepción (Chili).All authors
Publisher: 2015.
Dissertation: Thèse de doctorat : Ecologie Microbienne Marine : Paris 6 : 2015.
Thèse de doctorat : Ecologie Microbienne Marine : Universidad de Concepción (Chili) : 2015.
Edition/Format:   Computer file : Document : Thesis/dissertation : English
Summary:
En milieu marin, les communautés bactériennes hétérotrophes sont exposées à un mélange hétérogène de composés organiques dissous présentant différents degrés de labilité, qui peuvent contrôler à la fois leurs activités et leur composition. Dans le cadre de cette thèse, nous avons étudié la réponse de communautés bactériennes présentes dans des environnements côtiers contrastés à l'ajout
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Details

Genre/Form: Thèses et écrits académiques
Material Type: Document, Thesis/dissertation, Internet resource
Document Type: Internet Resource, Computer File
All Authors / Contributors: Marine Blanchet; Fabien Joux; Silvio Pantoja; Université Pierre et Marie Curie (Paris / 1971-2017).; Universidad de Concepción (Chili).; École doctorale des sciences de l'environnement d'Île-de-France (Paris / 1991-....).
OCLC Number: 911177901
Notes: Thèse soutenue en co-tutelle.
Titre provenant de l'écran-titre.
Description: 1 online resource
Responsibility: Marine Blanchet ; sous la direction de Fabien Joux et de Silvio Pantoja.

Abstract:

En milieu marin, les communautés bactériennes hétérotrophes sont exposées à un mélange hétérogène de composés organiques dissous présentant différents degrés de labilité, qui peuvent contrôler à la fois leurs activités et leur composition. Dans le cadre de cette thèse, nous avons étudié la réponse de communautés bactériennes présentes dans des environnements côtiers contrastés à l'ajout simple ou combiné de différentes sources naturelles de matière organique dissoute (MOD), préalablement photo oxydée ou non et présentant différentes bio réactivités. Dans un premier temps, nous avons étudié l'impact d'ajout de MOD labile provenant de méduses sur l'activité et la diversité bactériennes d'une communauté d'une lagune côtière méditerranéenne. Nous avons observé que la résilience des communautés bactériennes suite à cet ajout était plus importante pour les fonctions métaboliques que pour la diversité. Ceci suggère que les efflorescences de méduses peuvent entrainer des changements durables de la structure des communautés bactériennes en environnement côtier. Dans un deuxième temps, nous nous sommes intéressés à la possibilité d'un priming effect (accélération de la dégradation bactérienne de la MOD réfractaire en présence de MOD labile) en milieu côtier. Des expériences d'ajout simple ou combiné de MOD labile et récalcitrante ont été réalisées sur des communautés bactériennes de Mer Méditerranée et d'un fjord de Patagonie chilienne. Dans les deux cas, nous avons observé des changements plus importants de la composition communautaire bactérienne suite à un ajout combiné. Cependant, nous n'avons pas observé une plus forte consommation de MOD récalcitrante suite à l'ajout de composés labiles, ce qui suggère que le priming effect n'a pas eu lieu au cours de nos expériences. Enfin, nous avons étudié l'impact de la photodégradation de différentes sources de MOD (i.e. MOD récalcitrante de rivière, MOD labile provenant de phytoplancton) sur l'activité et la diversité de communautés bactériennes côtières. Nous avons observé que la photodégradation de la MOD issue d'une culture de phytoplancton entrainait à la fois une croissance bactérienne plus faible et une modification de la diversité bactérienne en faveur des Alphaprotéobactéries.

Heterotrophic bacterial communities in marine environment are exposed to a heterogeneous mixture of dissolved organic compounds with different bioavailability that may control both their activities and their composition. In the frame of this thesis, we studied the response of different coastal bacterial communities to the single or combined addition of various natural dissolved organic matter (DOM) photo-oxidized or not, presenting different bioavailability characteristics. Firstly, we studied the effects of the addition of highly bioreactive DOM derived from jellyfish on bacterial activities and community structure in a Mediterranean coastal lagoon. We observed that resilience of the bacterial community after the addition of DOM from the jellyfish was higher for metabolic functions than diversity, suggesting that jellyfish blooms can induce durable changes in the bacterial community structure in coastal lagoons. Secondly, we investigated the occurrence of priming effect (increase in microbial degradation of refractory DOM upon the addition of labile DOM) on coastal marine environments. Experiments with single or combined additions of recalcitrant and labile DOM sources were performed with a Mediterranean and a Patagonian fjord bacterial communities. In both cases we observed a greater effect of combined addition on bacterial community composition. However we did not observe an increase in recalcitrant DOM degradation of recalcitrant DOM following the addition of labile compounds, suggesting that priming effect did not occur during our experiments. Finally, we studied the impact of contrasted DOM (i.e. recalcitrant riverine DOM, labile phytoplankton-derived DOM) photodegradation on coastal bacterial communities activity and composition. We observed that photodegradation of phytoplankton-derived DOM led to a lower bacterial growth and changes in bacterial community diversity, in favour of Alphaproteobacteria.

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Dans un premier temps, nous avons \u00E9tudi\u00E9 l\'impact d\'ajout de MOD labile provenant de m\u00E9duses sur l\'activit\u00E9 et la diversit\u00E9 bact\u00E9riennes d\'une communaut\u00E9 d\'une lagune c\u00F4ti\u00E8re m\u00E9diterran\u00E9enne. Nous avons observ\u00E9 que la r\u00E9silience des communaut\u00E9s bact\u00E9riennes suite \u00E0 cet ajout \u00E9tait plus importante pour les fonctions m\u00E9taboliques que pour la diversit\u00E9. Ceci sugg\u00E8re que les efflorescences de m\u00E9duses peuvent entrainer des changements durables de la structure des communaut\u00E9s bact\u00E9riennes en environnement c\u00F4tier. Dans un deuxi\u00E8me temps, nous nous sommes int\u00E9ress\u00E9s \u00E0 la possibilit\u00E9 d\'un priming effect (acc\u00E9l\u00E9ration de la d\u00E9gradation bact\u00E9rienne de la MOD r\u00E9fractaire en pr\u00E9sence de MOD labile) en milieu c\u00F4tier. 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